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      民主化單細(xì)胞分析
      
			
      
				2019-04-25 10:31:25
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      艾倫研究所和華盛頓大學(xué)的科學(xué)家們開發(fā)了一種新的低成本技術(shù)，用于分析數(shù)十萬個細(xì)胞中的基因表達(dá)。基于分裂池連接的轉(zhuǎn)錄組測序(SPLiT-seq)是一種可擴(kuò)展的技術(shù)，用于表征單個細(xì)胞中的RNA，可用于鑒定腦和其他組織中發(fā)現(xiàn)的各種細(xì)胞類型。這項研究發(fā)表在本周的“科學(xué)”雜志上。
      

      民主化單細(xì)胞分析
      

      “為了理解任何多細(xì)胞生物系統(tǒng)，我們需要了解它的構(gòu)建塊及其細(xì)胞，”艾倫研究所的科學(xué)家Bosiljka Tasic說。“大腦中含有許多不同形狀和大小的細(xì)胞，但不存在對其進(jìn)行表征和分類的通用方法。在單細(xì)胞中表征RNA是一種對細(xì)胞進(jìn)行分類的方法，但現(xiàn)有方法價格昂貴且需要專門的設(shè)備。自SPLiT -seq可以在任何實驗室中使用基本設(shè)備完成，這可能會導(dǎo)致單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的更廣泛采用和標(biāo)準(zhǔn)化。“
      

      先前開發(fā)的測序技術(shù)要求在用標(biāo)準(zhǔn)遺傳條形碼標(biāo)記RNA之前分離每個細(xì)胞。使用SPLiT-seq，細(xì)胞永遠(yuǎn)不會被隔離。相反，細(xì)胞用作其自身RNA的隔離區(qū)。細(xì)胞池被分成多個組，其中條形碼被添加到它們的RNA中。該過程重復(fù)多次，以使每個細(xì)胞的RNA具有獨特的組合條形碼。這使研究人員能夠同時分析許多細(xì)胞的基因表達(dá)，并將其分類。
      

      “對于這個項目，我們使用SPLiT-seq在發(fā)育中的小鼠大腦和脊髓中分析了超過150,000個細(xì)胞，我們?yōu)樘囟?xì)胞類型定義了許多新的分子標(biāo)記，”電氣部合成生物學(xué)家Georg Seelig說。工程學(xué)和華盛頓大學(xué)的Paul G. Allen計算機(jī)科學(xué)與工程學(xué)院。“我們的實驗每個細(xì)胞只花費一美分.SPLiT-seq顯著降低了想要進(jìn)行單細(xì)胞分析但卻買不起昂貴的專用設(shè)備的實驗室的障礙。”
      

      “許多疾病，如阿爾茨海默氏癥和帕金森癥，都是從某些細(xì)胞類型的功能障礙開始的，”Tasic說。“洞察這些類型是什么以及哪些基因出錯了將導(dǎo)致更好地了解這些疾病如何開始和進(jìn)展，以及如何治療它們。”
      
			

			
        
      
			
      
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