利用真菌生產(chǎn)可再生能源
Ebru Alazi'黑客'是真菌黑曲霉中的酶產(chǎn)生系統(tǒng),以便更容易地生產(chǎn)可再生能源。她操縱了真菌,使其產(chǎn)生更多的果膠酶:主要用于食品工業(yè)和生產(chǎn)可再生能源的酶,如生物燃料。
真菌如黑曲霉從植物中提取以生長(zhǎng)。果膠是一種多糖 - 一種長(zhǎng)鏈糖 - 是植物細(xì)胞壁的一部分,可作為真菌的食物。當(dāng)A.niger感知到果膠時(shí),它會(huì)產(chǎn)生果膠酶。這些酶可以將果膠分解成更小的部分,因此真菌可以將它們運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞中并為它們提供能量。這已經(jīng)為人所知了,但Alazi發(fā)現(xiàn)了這個(gè)過(guò)程背后的機(jī)制。“我喜歡我的研究,它既是基礎(chǔ)又是應(yīng)用。首先,我獲得了關(guān)于黑曲霉果膠酶生產(chǎn)系統(tǒng)如何工作的基本知識(shí),然后我運(yùn)用這些知識(shí)來(lái)破解系統(tǒng)并促進(jìn)果膠酶的生產(chǎn)。”
Alazi首先發(fā)現(xiàn)了激活劑GaaR,這是一種激活編碼果膠酶基因表達(dá)的蛋白質(zhì)。粗略地說(shuō),當(dāng)A.niger感覺(jué)到果膠時(shí),GaaR被激活。此外,她找到了抑制因子GaaX。當(dāng)真菌在其環(huán)境中不感知果膠時(shí),阻遏物GaaX被激活。然后GaaX禁用活化劑GaaR并停止果膠酶生產(chǎn)。她發(fā)現(xiàn)的第三個(gè)成分是引起豐富果膠酶生成的誘導(dǎo)劑分子:2-酮-3-脫氧-L-半乳糖酸鹽,一種果膠的分解代謝產(chǎn)物。“我的研究提供了關(guān)于確切機(jī)制的適當(dāng)線索,因此我們的假設(shè)現(xiàn)在如下:誘導(dǎo)劑與阻遏物GaaX結(jié)合,因此它不再能抑制活化劑GaaR,”Alazi解釋說(shuō)。“通過(guò)這種方式,GaaR可以開(kāi)始激活基因表達(dá)并產(chǎn)生果膠酶。
在了解了該機(jī)制后,Alazi用紫外光誘變真菌,以分離具有獨(dú)特果膠酶生產(chǎn)特性的突變體。發(fā)現(xiàn)一個(gè)突變體具有GaaR等位基因,其不受阻遏物GaaX的抑制。“因此通常情況下,阻遏物GaaX會(huì)使GaaR失活,因此A.niger不會(huì)產(chǎn)生果膠酶,”她說(shuō)。“但是當(dāng)存在誘導(dǎo)物時(shí),它與GaaX結(jié)合,激活劑GaaR可以自由地進(jìn)入并且真菌開(kāi)始產(chǎn)生果膠酶。”然而,Alazi說(shuō),有了這個(gè)等位基因,誘導(dǎo)物的存在是不必要的:GaaR等位基因會(huì)自動(dòng)激活果膠酶基因的表達(dá)。此外,她還制造了比正常情況產(chǎn)生更多激活劑GaaR的突變體。
“使用這些新設(shè)計(jì)的菌株,我們可以在任何碳源上生產(chǎn)果膠酶,包括來(lái)自農(nóng)業(yè),林業(yè)或食品工業(yè)的廢物流。這使得大量生產(chǎn)果膠酶更便宜,更可持續(xù)。然后這些果膠酶可以用于從植物生物質(zhì)中生產(chǎn)可再生生物燃料。“
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