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      研究揭示了腦膜炎和胃腸炎的遺傳過程
      
			
      
				2019-03-15 10:08:28
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      萊斯特大學(xué)科學(xué)家開發(fā)的創(chuàng)新計算機軟件正在揭示導(dǎo)致腦膜炎和胃腸炎的致命病原體的基因組成。該軟件名為PhasomeIt，可快速掃描大量基因組并識別其相變基因，同時還將所有這些基因相互比較。這有助于我們理解一系列致命疾病的遺傳過程。
      

      研究揭示了腦膜炎和胃腸炎的遺傳過程
      

      來自萊斯特大學(xué)的研究人員，由遺傳學(xué)和基因組生物學(xué)系的Chris Bayliss博士領(lǐng)導(dǎo)，將該軟件應(yīng)用于兩個細(xì)菌家族的大量基因組序列 - 腦膜炎奈瑟球菌(腦膜炎的重要原因)和彎曲桿菌空腸炎(食源性胃腸炎的最常見原因)。這些研究發(fā)表在PLOS One和Microbial Genomics期刊上。
      

      Bayliss博士解釋說：“我們和其他人預(yù)測，對這些大型基因組的深入分析將揭示這些病原體如何適應(yīng)其人類和家禽宿主的生命以及遺傳變化如何導(dǎo)致有害感染。”
      

      現(xiàn)代DNA測序技術(shù)現(xiàn)在產(chǎn)生了大量的基因組 - 生物體的整個遺傳內(nèi)容 - 許多不同生物的信息 - 從人類到微生物。
      

      在許多情況下，甚至有太多數(shù)據(jù)無法用當(dāng)前可用的計算機軟件進行有效分析。
      

      “這兩種細(xì)菌用于適應(yīng)環(huán)境和宿主壓力的一種機制是可逆地切換開啟或關(guān)閉編碼負(fù)責(zé)與宿主相互作用的分子的基因，”博士的Joe Wanford解釋道。學(xué)生在萊斯特大學(xué)遺傳學(xué)和基因組生物學(xué)系從事研究工作。
      

      “在許多情況下，該過程是有利的，因為ON狀態(tài)基因允許與宿主細(xì)胞表面(例如在喉嚨中)的緊密相互作用，而OFF狀態(tài)允許逃避宿主抗體，這可能最終導(dǎo)致細(xì)菌死亡。由于其DNA的特異性鑒定特征，這些所謂的相變基因中的一些可以很容易地鑒定，但直??到現(xiàn)在還沒有辦法快速分析這些基因在多個基因組中的存在和分布。
      

      研究小組的分析表明，相變基因主要分布在致病(引起疾病)和共生(存在于體內(nèi)，不會造成損害)的細(xì)菌種類之間，但這些基因的存在或表達存在輕微差異?？赡茉趶臒o癥狀的我們的身體殖民化到完全疾病的過渡中發(fā)揮作用。
      

      目前正在他們的實驗室進行工作，以表征這些基因在疾病過程中的特定作用。
      

      Bayliss博士補充說：“我們相信我們的新軟件對于分析不斷增加的基因組序列數(shù)量至關(guān)重要，并將繼續(xù)為我們的細(xì)菌共生體的生命周期提供關(guān)鍵見解。”
      
			

			
        
      
			
      
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