更多古老的病毒隱藏在我們的DNA中 而不是我們想象的
認(rèn)為你的DNA是全人類嗎?再想想。一項(xiàng)新發(fā)現(xiàn)表明,它比科學(xué)家先前所認(rèn)為的人類更少。剛剛在我們自己的基因之間發(fā)現(xiàn)了19種新的非人類DNA,這些DNA是由數(shù)十萬年前首次感染我們祖先的病毒留下的。研究人員在美國國家科學(xué)院院刊上發(fā)表研究結(jié)果的科學(xué)家表示,在所研究的2,500人中約有50人中發(fā)現(xiàn)了一段新發(fā)現(xiàn)的DNA,它包含完整的完整病毒基因配方。
它是否可以復(fù)制或復(fù)制,目前尚不清楚。但是對古代病毒DNA的其他研究表明它可以影響攜帶它的人類。除了發(fā)現(xiàn)這些新的延伸,科學(xué)家還證實(shí)了近年來其他科學(xué)家在人類基因組中發(fā)現(xiàn)的17種其他病毒DNA 。
該研究考察了來自世界各地的人們的DNA或基因組的整個(gè)范圍,其中包括來自非洲的大量數(shù)據(jù) - 現(xiàn)代人類的祖先在世界各地遷移之前就已經(jīng)發(fā)源。該團(tuán)隊(duì)使用復(fù)雜的技術(shù)將每個(gè)人基因組的關(guān)鍵區(qū)域與“參考”人類基因組進(jìn)行比較。
研究人員在塔夫茨大學(xué)和密歇根大學(xué)醫(yī)學(xué)院工作,并在國立衛(wèi)生研究院的資助下完成了研究結(jié)果。
HERV-enly找到
這些發(fā)現(xiàn)增加了科學(xué)已經(jīng)知道的人類內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒或HERVs。這就是古代傳染病毒的名稱,它將自己的RNA遺傳物質(zhì)的基于DNA的拷貝插入到我們的祖先的基因組中。它們是包含導(dǎo)致艾滋病的現(xiàn)代人類免疫缺陷病毒的同類病毒的一部分。
經(jīng)過幾代人的努力,病毒產(chǎn)生的DNA在人類復(fù)制時(shí)不斷被復(fù)制和傳播。這就是它今天在DNA中的結(jié)果。事實(shí)上,我們認(rèn)為“人類”DNA的大約8%實(shí)際上來自病毒。在某些情況下,HERV序列已被人體采用以達(dá)到有用的目的,例如幫助孕婦的身體在發(fā)育中的胎兒周圍建立細(xì)胞層以保護(hù)其免受母體血液中毒素的影響。
新的HERV是HERV-K家族的一部分。剛剛發(fā)現(xiàn)的完整的全病毒基因組或原病毒是在X染色體上; 它被稱為Xq21。它只是發(fā)現(xiàn)隱藏在人類DNA中的第二個(gè)完整原病毒。
用研究人員自己的話說:
“這個(gè)看起來像它能夠產(chǎn)生感染性病毒,如果這是真的很令人興奮,因?yàn)樗梢宰屛覀冄芯亢芫靡郧鞍l(fā)生的病毒流行病,”資深作者和病毒學(xué)家John Coffin博士說。塔夫茨大學(xué)醫(yī)學(xué)院。“這項(xiàng)研究提供了理解逆轉(zhuǎn)錄病毒和人類近來如何共同進(jìn)化所必需的重要信息。”
“許多研究試圖將這些內(nèi)源性病毒元素與癌癥和其他疾病聯(lián)系起來,但一個(gè)主要困難是我們還沒有真正找到所有這些疾病,”共同第一作者Zachary H. Williams博士說。 。波士頓塔夫斯大學(xué)薩克勒大學(xué)生物醫(yī)學(xué)科學(xué)學(xué)院的學(xué)生。“許多最有趣的元素只能在一小部分人中找到,這意味著你必須篩選大量的人才能找到它們。”
“這是一個(gè)驚心動(dòng)魄的發(fā)現(xiàn),”共同第一作者,博士Julia Wildschutte博士說,他開始了博士學(xué)位。學(xué)生在塔夫茨的棺材實(shí)驗(yàn)室。“它將為研究打開許多大門。更重要的是,我們在本文中已經(jīng)證實(shí),與參考人類基因組相比,我們可以使用來自多個(gè)個(gè)體的基因組數(shù)據(jù)來檢測新的HERV。但這也向我們證明了一些人進(jìn)行插入我們無法映射回參考。“
UM遺傳學(xué)研究員杰弗里·基德博士與Wildschutte合作,當(dāng)時(shí)她是實(shí)驗(yàn)室團(tuán)隊(duì)的成員?;抡f:“這些是古代事件的殘余,這些事件并未在整個(gè)人口中得到修復(fù),而是發(fā)生在今天活著的一些人的祖先身上。” “有許多其他HERVs將自身插入人類基因旁邊或靠近它們,并對其表達(dá)產(chǎn)生影響。我們有興趣應(yīng)用這些方法來尋找其他類型的病毒或移動(dòng)元素插入。”
基因團(tuán)隊(duì)合作
密歇根小組使用方法來表征Kidd和他的團(tuán)隊(duì)開發(fā)的重復(fù)DNA序列,而Coffin和Williams則采用了互補(bǔ)技術(shù)。Wildschutte現(xiàn)在在鮑靈格林州立大學(xué)。
他們檢查的許多基因組來自1000 Genomes Project,這是一項(xiàng)國際合作。另一組基因組來自于斯坦福大學(xué)的Kidd及其同事作為人類基因組多樣性項(xiàng)目的一部分,其重點(diǎn)是來自非洲志愿者的DNA樣本。
后面的這些樣本顯示出更多的HERV跡象,與非洲人群的高水平遺傳多樣性一致。這種多樣性源于非洲大陸人口的長期穩(wěn)定和混合 - 而不是歐洲,亞洲和美洲的其他人口,這些人口源于古代特定的遷徙。
對人類中的所有HERV插入進(jìn)行編目將需要對整個(gè)人類基因組進(jìn)行更多掃描,隨著技術(shù)的改進(jìn)和變得更便宜,這些基因組變得越來越容易。雖然潛伏在我們DNA中的完整原生動(dòng)物可能很少見,但其他HERV序列對我們的健康或疾病的影響可能不大。
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