科學家從幾千年前的口香糖中提取出完整的人類基因組
似乎口香糖并不是一個新的趨勢!研究人員發(fā)現(xiàn)口香糖有5,700年的歷史,它提供了關于古代DNA的線索。一項帶有這一發(fā)現(xiàn)的研究發(fā)表在《自然通訊》雜志上。它的標題是“一個5,700歲的人類基因組和口腔微生物從咀嚼白樺瀝青。”
哥本哈根大學的一個研究小組使用了一塊挖出來的口香糖,它被咀嚼并從中提取了人類基因組。他們推測,這種口香糖是用樺木做成的,用來休閑咀嚼。根據(jù)專家的說法,這是第一次從出土的文物中提取出整個古代基因組,而不是骨頭。
有報道說,在舊石器時代,樺木瀝青被用作膠水。這是一種棕色的黑色膠狀物質,通過加熱樺樹的樹皮制成。一旦冷卻,它需要咀嚼,使其可用于日常使用的膠水。一些專家說,它可能也被用作牙痛或防腐劑。他們補充說,它可能也被用作休閑時的口香糖。他們寫道,“在歐洲發(fā)現(xiàn)的最古老的咀嚼瀝青的例子可以追溯到中生代,用氣相色譜-質譜(GC-MS)進行的化學分析表明,其中許多是由樺木(Betula擺)制成的。
丹麥南部Rødbyhavn以東Syltholm的挖掘工作是由Lolland-Falster博物館在Fehmarn隧道工作期間進行的。環(huán)球研究所的博士后學生泰斯·詹森(Theis Jensen)正在攻讀博士學位,他是西爾霍爾姆發(fā)掘工作的一部分。詹森說:“西爾霍爾姆完全是獨一無二的。幾乎所有的東西都封在泥里,這意味著保存有機遺跡是絕對現(xiàn)象。”他補充說:“這是丹麥最大的石器時代遺址,考古發(fā)現(xiàn)表明,占據(jù)遺址的人們大量開采野生資源,進入新石器時代,這是最早將農(nóng)耕和馴養(yǎng)動物引入南斯堪的納維亞半島的時期。”
首席研究員、哥本哈根大學環(huán)球研究所副教授漢斯·施羅德(Hannes Schroeder)在一份聲明中說,“從骨頭以外的任何東西中獲得一個完整的古代人類基因組是令人驚訝的。更有甚者,我們還從口腔微生物和幾種重要的人類病原體中提取了DNA,這使得這成為非常有價值的古代DNA來源,特別是在我們沒有人類遺骸的時期。”
仔細觀察基因組,他們發(fā)現(xiàn)口香糖的使用者是一名女性,她與生活在中歐的狩獵采集者的關系比生活在斯堪的納維亞中部地區(qū)的人更密切。他們從基因組推測,她最有可能是藍眼睛,深色頭發(fā)和深色皮膚。研究小組還從口香糖中分離出可能與口香糖接觸的植物和動物的DNA。他們特別發(fā)現(xiàn)了鴨和榛子,雌性可能在嚼口香糖之前或之前吃掉。
接下來,研究人員觀察了口香糖中發(fā)現(xiàn)的微生物的基因組。這些可能是咀嚼它的雌性動物的微生物、共生生物和口腔和胃腸道的機會細菌的基因組。施羅德解釋說,“這種保存非常好,我們成功地提取了許多不同的細菌物種,這些細菌是口腔微生物群的特征。我們的祖先生活在一個不同的環(huán)境中,有著不同的生活方式和飲食,因此,我們有興趣了解這是如何反映在他們的微生物群中的。“他補充說,其中一個微生物基因組被發(fā)現(xiàn)是愛潑斯坦-巴爾病毒。他們還寫道,他們的foud,“奈瑟菌亞菌屬和羅蒂亞粘菌屬,以及幾種細菌包括在紅色復合體(即。牙齦卟啉單胞菌、連翹坦納氏菌和牙周炎)“。施羅德還說,“它可以幫助我們理解病原體是如何隨著時間的推移而進化和傳播的,以及是什么使它們在特定環(huán)境中變得特別致命。與此同時,它可能有助于預測一種病原體在未來將如何表現(xiàn),以及如何遏制或根除它。”
研究小組得出結論,“咀嚼的樺木瀝青是古代人類和非人類DNA的極好來源。在咀嚼過程中,由于瀝青的無菌和疏水特性,DNA被困在保存的瀝青中,這兩種特性都能抑制微生物和化學衰變。“他們還寫道,“被咀嚼的白樺瀝青中保存的基因組信息提供了人們生活的快照,提供了關于遺傳祖先、表型、健康狀況甚至生存的信息。此外,微生物DNA提供了關于我們祖先口腔微生物群的組成以及特定口腔微生物和重要人類病原體進化的信息。
這項研究由維爾倫基金會和歐盟的研究方案Horizon2020通過瑪麗·居里行動資助。
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