對于CRISPR 在插入前先調(diào)節(jié)DNA片段可獲得最高的效率
伊利諾伊大學(xué)的研究人員使用CRISPR-Cas9基因編輯系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)了將基因插入人細(xì)胞的最高報道率,這是將CRISPR用于臨床基因治療應(yīng)用的必要步驟。
通過化學(xué)調(diào)節(jié)待插入DNA的末端,新技術(shù)的效率是當(dāng)前方法的五倍。研究人員發(fā)現(xiàn),在人類腎臟細(xì)胞系中測試的各個遺傳部位的情況都得到了改善,甚至看到一個部位的插入率達(dá)到了65%,而之前的最高水平為15%。
在化學(xué)和生物分子工程教授趙慧敏的帶領(lǐng)下,研究人員在《自然化學(xué)生物學(xué)》雜志上發(fā)表了他們的工作。
研究人員發(fā)現(xiàn),CRISPR是關(guān)閉或“敲除”基因的有效工具。但是,在人類細(xì)胞中,插入或“敲入”基因并不是一種非常有效的方法。
負(fù)責(zé)伊利諾伊州卡爾·R·沃斯基因組生物學(xué)研究所生物系統(tǒng)設(shè)計主題的趙說:“一種好的敲入方法對于基因治療應(yīng)用和研究基因功能的基礎(chǔ)生物學(xué)研究都很重要。” “采用敲入法,我們可以在任何基因上添加標(biāo)簽,研究其功能,并查看基因表達(dá)如何受到癌癥或染色體結(jié)構(gòu)變化的影響?;蛘咴诨蛑委煈?yīng)用中,如果某人患有由癌癥引起的疾病,缺失的基因,我們希望能夠插入它。”
為了尋找提高效率的方法,Zhao的小組研究了13種不同的方法來修飾插入的DNA。他們發(fā)現(xiàn),DNA末端的微小變化增加了插入的速度和效率。
然后,研究人員測試了使用CRISPR-Cas9精確靶向插入的特定位點(diǎn),將不同大小的末端修飾的DNA片段插入基因組中的多個點(diǎn)。他們發(fā)現(xiàn),即使插入較大的DNA片段(最難插入的片段),效率也提高了2至5倍。
“我們推測效率提高了很多,因?yàn)閷δ┒说幕瘜W(xué)修飾穩(wěn)定了我們插入的DNA,”趙說。“通常,當(dāng)您嘗試將DNA轉(zhuǎn)移到細(xì)胞中時,它會被從末端吞噬的酶降解。我們認(rèn)為我們的化學(xué)添加劑可以保護(hù)末端。更多的DNA進(jìn)入細(xì)胞核,并且DNA更穩(wěn)定,所以這就是為什么我認(rèn)為它有更高的機(jī)會整合到染色體中。”
趙的研究小組已經(jīng)在基因功能研究中使用該方法標(biāo)記必需基因。他們故意使用現(xiàn)成的化學(xué)物質(zhì)來修飾DNA片段,以便其他研究團(tuán)隊可以將相同的方法用于自己的基因研究。
“我們過去已經(jīng)開發(fā)了很多敲入方法,但是我們從未想過僅使用化學(xué)試劑來增加我們想要插入的DNA的穩(wěn)定性,”趙說。“這是一個簡單的策略,但是有效。”
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