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      發(fā)表了微生物譜以支持腸道研究領(lǐng)域的發(fā)展
      
			
      
				2019-09-13 09:26:05
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			  來(lái)源：
			
      
		
      
				
		
      
			
      根據(jù)喬治華盛頓大學(xué)(GW)研究人員在PLOS ONE期刊上發(fā)表的研究，有157種生物形成了健康人體腸道的基線生物群落。如果考慮密切相關(guān)的蛋白質(zhì)組，基線微生物譜，稱為GutFeelingKB，可以擴(kuò)展到863種生物。這些信息將作為醫(yī)生，患者和研究人員的參考清單，讓他們了解“正常”人類微生物組的樣子。
      

      發(fā)表了微生物譜以支持腸道研究領(lǐng)域的發(fā)展
      

      在進(jìn)行任何類型的臨床前或臨床研究之前，必須全面了解居住在健康人體腸道中的微生物的類型和比例。對(duì)于希望找到改變微生物組，治療疾病或改善治療結(jié)果的方法的研究人員來(lái)說(shuō)，這也很重要。GutFeelingKB可以作為研究人類微生物組的健康控制。
      

      為了編制他們的數(shù)據(jù)庫(kù)，該研究小組對(duì)來(lái)自華盛頓特區(qū)招募的16名健康參與者的48份糞便樣本進(jìn)行了遺傳測(cè)序，此外還使用了從人類微生物組項(xiàng)目下載的50個(gè)糞便宏基因組樣本，這些樣本也被篩選為健康人。在GutFeelingKB中描述的157種生物中，20%是梭菌，19%是芽孢桿菌，17%是腸桿菌，14%是腸桿菌，厚壁菌門(mén)20%是梭菌，14%是乳桿菌 - 益生菌中發(fā)現(xiàn)的所有細(xì)菌類別酸奶等食物。研究小組指出，所有樣本中共有84種生物，這表明這組細(xì)菌可能是人類腸道的核心物種。
      

      該研究得到了國(guó)家科學(xué)基金會(huì)的資助，國(guó)家推進(jìn)轉(zhuǎn)化科學(xué)中心的臨床和轉(zhuǎn)化科學(xué)獎(jiǎng)項(xiàng)目，McCormick基因組和蛋白質(zhì)組學(xué)中心以及GW和兒童國(guó)家的臨床轉(zhuǎn)化科學(xué)研究所(CTSI)的資助。華盛頓特區(qū)原始序列數(shù)據(jù)是在KamTek，Inc。生成的，使用MiSeq Illumina儀器在馬里蘭州羅克維爾的蒙哥馬利學(xué)院進(jìn)行補(bǔ)貼定價(jià)。
      

      這項(xiàng)研究展示了多學(xué)科團(tuán)隊(duì)科學(xué)推動(dòng)轉(zhuǎn)化研究的力量，因?yàn)樵搱F(tuán)隊(duì)涉及來(lái)自GW內(nèi)多個(gè)機(jī)構(gòu)，學(xué)科和學(xué)校的同事，”CTSI資助的信息學(xué)聯(lián)合負(fù)責(zé)人Keith A. Crandall博士說(shuō)。作者，GW的米爾肯公共衛(wèi)生學(xué)院計(jì)算生物學(xué)研究所所長(zhǎng)。“GutFeelingKB提供了一個(gè)基礎(chǔ)模型和初步數(shù)據(jù)，以開(kāi)始了解健康腸道微生物組的多樣性，這是任何試圖檢測(cè)與微生物組變化相關(guān)的疾病的研究的關(guān)鍵組成部分。”
      

      除了創(chuàng)建GutFeelingKB之外，該研究小組還發(fā)表了一份名為FecalBiome的新型糞便生物群落人口報(bào)告，該報(bào)告具有臨床應(yīng)用能力。FecalBiome可以幫助醫(yī)生將患者的微生物組與健康個(gè)體的微生物組進(jìn)行比較，使他們能夠更好地評(píng)估糞便移植物和其他微生物組產(chǎn)品的有效性。研究團(tuán)隊(duì)還為醫(yī)生開(kāi)發(fā)了一個(gè)原型報(bào)告模板，以便將信息傳遞給患者。
      

      “揭示腸道微生物物種與人體宿主之間復(fù)雜的代謝交換對(duì)于各種各樣的健康狀況，甚至可能是我們的情緒都有著巨大的影響。微生物組可以”調(diào)整“以增加有益的細(xì)菌種群?jiǎn)?我們的飲食如何影響這種調(diào)節(jié)“我們很高興知識(shí)庫(kù)將讓我們量化這些變化，并將它們與人類健康聯(lián)系起來(lái)，”Hiroki Morizo??no博士說(shuō)，他是CTSI資助的信息學(xué)聯(lián)合負(fù)責(zé)人，共同作者，兒童國(guó)家和副研究教授的生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)主任GW醫(yī)學(xué)與健康科學(xué)學(xué)院的基因組學(xué)，精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和兒科學(xué)。
      
			

			
        
      
			
      
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