實時成像捕獲逆轉(zhuǎn)錄病毒移碼機(jī)制
核糖體移碼是許多病毒中的特征性過程,特別是逆轉(zhuǎn)錄病毒,用于在宿主內(nèi)增殖?,F(xiàn)在,研究人員開發(fā)了詳細(xì)的成像技術(shù)和計算工具,以便在活細(xì)胞中以前所未有的細(xì)節(jié)可視化,量化和理解移碼機(jī)制。該研究的細(xì)節(jié)發(fā)表在Molecular Cell上。
當(dāng)病毒感染宿主細(xì)胞時,它會操縱宿主核糖體來制造病毒蛋白。在移碼突變中,翻譯RNA的核糖體沿著核苷酸序列向后或向前滑動一個點,這導(dǎo)致產(chǎn)生全新的蛋白質(zhì)序列。
為了更深入地了解這一過程中發(fā)生的事情,科羅拉多州立大學(xué)科學(xué)家Tim Stasevich和他的團(tuán)隊設(shè)計了蛋白質(zhì)標(biāo)簽,以便在RNA翻譯發(fā)生時以不同的顏色結(jié)合并發(fā)出熒光。他們在部分HIV-1病毒中監(jiān)測單個RNA在移碼期間轉(zhuǎn)化為兩個獨特的蛋白質(zhì)鏈。
在經(jīng)過較長時間的非移位后,該團(tuán)隊觀察到移動發(fā)生在突發(fā)的活動中。例如,已知HIV病毒大約5%的時間輸出移碼的蛋白質(zhì)。雖然可能預(yù)期大量RNA會偶爾移碼,但卻觀察到8%的RNA移位速度非常高,因此證明移碼只發(fā)生在一小部分RNA中。
雖然目前尚不清楚幀移位RNA與其他RNA的確切區(qū)別,但這些觀察結(jié)果提供了這種特殊的病毒RNA子集可以為抗病毒療法提供目標(biāo)的希望。另一位科羅拉多州立大學(xué)研究人員的計算機(jī)模擬顯示,只有當(dāng)病毒移碼中涉及的核糖體有時會停留在移碼位點時,才會發(fā)生作為研究一部分觀察到的熒光數(shù)據(jù)的波動。該模型表明,這可能導(dǎo)致核糖體“交通擁堵”,在常規(guī)翻譯停止后很長時間內(nèi)維持移碼蛋白的產(chǎn)生。
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