人類細胞地圖集(HCA)聯(lián)盟發(fā)布了國際計劃努力創(chuàng)建所有人體細胞綜合參考圖的藍圖，該項目將成為更深入了解人類健康以及診斷，監(jiān)測和治療的基礎。疾病。藍圖的發(fā)布 - 作為白皮書發(fā)布到HCA網(wǎng)站 - 恰逢HCA組織委員會發(fā)表了一篇自然評論，總結了該聯(lián)盟的愿景和使命。

此外，該聯(lián)盟今天還宣布即將從HCA收集的第一百萬個免疫細胞中釋放基因表達譜，最初的里程碑是收集代表幾個組織和器官的至少3000萬個細胞用于地圖集的初稿。這些數(shù)據(jù)將于11月初發(fā)布在在線資料庫中，供研究人員免費使用。

藍圖和數(shù)據(jù)發(fā)布在由以色列雷霍沃特的魏茨曼科學研究所主辦的第二屆HCA大會上發(fā)布。會議慶祝財團成立一周年，標志著其從規(guī)劃到運營階段的正式過渡。

“在過去的一年里，國際科學界，從醫(yī)生到計算機科學家，已經(jīng)參與了一個開放的過程來計劃如何制作這個革命性的地圖集，”Aviv Regev說，他是核心成員，教職員和主任。麻省理工學院和哈佛大學布拉德曼細胞觀察站和細胞電路計劃;一名HHMI調(diào)查員;麻省理工學院生物學教授;與HCA組委會的Wellcome Trust Sanger Institute的Sarah Teichmann共同主持。“我們一起畫了藍圖?，F(xiàn)在是時候開始建房了。”

“完成時將為地圖集收集的數(shù)據(jù)將為更深入研究細胞功能和相互作用提供切入點，無論是在其家庭組織內(nèi)還是更廣泛地在整個身體內(nèi)，”細胞遺傳學負責人Teichmann說。桑格研究所，劍橋大學物理系研究主任，劍橋丘吉爾學院高級研究員。“隨著時間的推移，這些知識將對人類生物學和人類健康的科學理解產(chǎn)生變革性影響。”

全球戰(zhàn)略藍圖

HCA于2016年啟動，目標是人類基因組計劃的范圍雄心勃勃：創(chuàng)建所有人體細胞的參考目錄，其比例，位置以及它們之間的相互作用。白皮書指出，對于地圖集的初稿，該聯(lián)盟將使用大規(guī)模平行的單細胞RNA測序(一套能夠鑒定基因的基因組技術)研究和繪制來自選定器官和組織的3億至1億個細胞。一次成千上萬個細胞中的表達譜，用于表征其他分子的相關技術，以及用于繪制細胞位置和相互作用的空間方法。

該聯(lián)盟的長期目標是分析至少100億個細胞，覆蓋所有組織，器官和系統(tǒng)，代表健康組織以及受特定疾病和病癥影響的組織。完整的地圖集將盡可能多樣化，捕捉一系列疾病，地理位置，環(huán)境和年齡組。

治理

除了確定地圖集初稿的目標和范圍外，白皮書還概述了財團的組織和治理結構，重點強調(diào)科學多樣性和包容性。它還提供了一套以道德，公平和開放為基礎的指導原則，反映了財團的科學基層起源。

HCA由HCA的決策機構組委會(OC)指導和管理。該OC由來自10個國家的27名科學家組成，目前由Aviv Regev(Broad Institute)和Sarah Teichmann(Wellcome Trust Sanger Institute)共同擔任主席。在此處查看HCA領導的完整列表。

“HCA是由科學家構思和發(fā)起的，它由來自10個國家的19個機構的科學家管理和管理，”日本RIKEN(物理和化學研究所)基因組技術部門主任Piero Carninci說。和RIKEN生命科學技術中心副主任。“來自世界各地的數(shù)十位科學家，包括亞洲各國，已經(jīng)表達了他們對參與HCA研究并為其提供專業(yè)知識的興趣。”

數(shù)據(jù)來自第一百萬個細胞，并且路徑達到了一百億個

今天宣布的免疫細胞表達數(shù)據(jù)將于11月初在公共在線資源中提供，包括從骨髓和健康人類供體的臍帶血收集的大約一百萬個細胞的單細胞RNA表達譜。

該表達數(shù)據(jù)將免費提供，允許科學界成員在研究中使用該信息。對開放獲取的承諾是HCA的核心價值之一，以及關鍵的道德考慮因素。

人類細胞圖譜(HCA)是一個國際合作聯(lián)盟，旨在創(chuàng)建所有人類細胞的全面參考圖- 生命的基本單位 - 作為理解人類健康和診斷，監(jiān)測和治療疾病的基礎。HCA是一種基礎的，開放的資源，用于繪制全身的細胞，組織，器官和系統(tǒng)。HCA將影響生物學和醫(yī)學的各個方面，推動翻譯發(fā)現(xiàn)和應用，并最終開創(chuàng)精準醫(yī)學的新時代。