新的基因組工具可以搜尋小麥的野外過去以改善未來的作物
今天發(fā)布的一個新的遺傳目錄將使研究人員和育種者能夠掃描現(xiàn)代小麥野生近緣種的基因組,以發(fā)現(xiàn)馴化失去的抗病特性。
在開放野生小麥之后可以進行時間旅行拖網(wǎng),該目錄包括150種野生小麥的遺傳序列,這些野生小麥屬于稱為Aegilops tauschii ssp的山羊草種。strangulata。這種野生近緣種在里海的肥沃新月中發(fā)現(xiàn),已經(jīng)貢獻了D基因組支柱,這是在面包小麥中發(fā)現(xiàn)的三個基因組之一。
該目錄是由John Innes中心,英國諾里奇和堪薩斯州立大學(xué)的小麥研究人員領(lǐng)導(dǎo)的國際財團的人群資助結(jié)果。來自15個國家的學(xué)術(shù)機構(gòu)和行業(yè)的貢獻者籌集了15萬美元來資助測序。
來自John Innes中心的Brande Wulff博士解釋了該項目背后的動機:“如果你對一個人進行排序,你就會得到一個快照。所以,為了理解一個物種帶來的整個遺傳多樣性,我們決定排序不是一個,而是150.”
野生小麥具有豐富的野生特征,包括種子破碎,長時間生長和令人不快的穗狀花序,可導(dǎo)致狗和其他動物窒息。
“在我們的狩獵采集者正在向農(nóng)業(yè)過渡的時候,他們會遇到一片植物和野生小麥。如果他們的日常面包依賴這些,我們的祖先就會餓死。”武爾夫。
一萬年的馴化和集約化育種使小麥成為高營養(yǎng),高產(chǎn),標(biāo)志性的作物,為當(dāng)今世界大部分人口提供食物。
但這需要付出代價。耐寒的親戚有他們的優(yōu)良小麥品種堂兄弟沒有的東西:遺傳多樣性,其中包括保護性狀,如抗病性以及開花時間和微量營養(yǎng)素的變化。
負責(zé)該項目的堪薩斯州立大學(xué)的杰西波蘭博士解釋說:“在過去的100年里,育種者和農(nóng)民一直在努力將一些遺傳多樣性招募回精英階層,但這是一場艱難的斗爭。多年的育種生產(chǎn)出一種小麥品種,它結(jié)合了高產(chǎn),面包制作特性和野生親緣的一種抗性基因。“
Open Wild Wheat目錄提供了一個“多樣性”小組,允許研究人員和育種者搜索候選抗病基因和其他有用的變異。
該資源與兩種互補技術(shù)一起出現(xiàn):速度克隆,一種允許育種者克隆從目錄中回收的候選基因的資源;和速度繁殖,由Wulff博士和昆士蘭大學(xué)的同事共同開發(fā)的集約化小麥種植平臺。在田間試驗之前,速度育種允許野生親緣的性狀迅速轉(zhuǎn)變?yōu)閮?yōu)良品種。
來自CIMMYT的合作者之一Carolina Paola Sansaloni博士說:“我們將回到小麥的野生近緣種,以確定并將現(xiàn)代品種中的小麥進化和馴化過程中丟失的耐寒基因納入其中。”
由財團組裝的目錄包含足夠的數(shù)據(jù),如果打印在A4紙上,幾乎可以伸展到月球。
在這個統(tǒng)計干草堆中尋找針頭涉及掃描小序列特征的候選基因的遺傳變異 - 候選基因 - 與小麥莖銹病或白粉病等疾病的抗性或易感性相關(guān)。
Wulff博士說,這項技術(shù)是有效的:“我們已經(jīng)使用這種技術(shù)克隆了四種抗性基因,因此我們知道它是有效的。我們可以真正加速抗性基因的發(fā)現(xiàn)。我們可以從過去恢復(fù)最好的基因來創(chuàng)造一個偉大的收獲甚至更大。“
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