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      兩種紅海細菌的基因組測序突出了它們作為工業(yè)工作的潛力
      
			
      
				2019-03-18 10:17:41
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      對紅海中兩種細菌菌株的分析表明，它們富含基因簇，可能激活各種工業(yè)上有用的化合物的合成，從新型抗生素，抗癌劑和色素到有用于作物保護和食品工業(yè)的化合物。
      

      兩種紅海細菌的基因組測序突出了它們作為工業(yè)工作的潛力
      

      細菌是生物活性化學化合物的豐富資源，KAUST計算生物科學研究中心的Magbubah Essack解釋說，能夠承受紅海高鹽度溫水的細菌菌株有望產(chǎn)生適合工業(yè)應用的堅固酶。
      

      該團隊對兩種芽孢桿菌種的基因組進行了測序：從沙棘阿拉伯西海岸的Rabigh Harbour Lagoon的微生物墊中采集的紅樹林泥和B. paralicheniformis Bac84收集的B.paralicheniformis Bac48。將這兩個與其他三個B.palicheniformiform和九個地衣芽孢桿菌菌株的記錄基因組進行比較。與其他芽孢桿菌菌株相比，紅海菌株具有與生物活性化合物合成相關(guān)的更多數(shù)量的基因簇。
      

      該小組還報告了首次使用計算機程序來鑒定副傷寒沙門氏菌菌株中的基因簇，在這種情況下，B. paralicheniformis Bac48，稱為反式酰基轉(zhuǎn)移酶非核糖體肽合成酶/聚酮合酶，與生產(chǎn)相關(guān)一組特定的化合物。
      

      該研究的第一作者，計算生物科學家Ghofran Othoum說：“研究結(jié)果肯定了這樣一個前提，即紅海是一個代謝獨特的環(huán)境，值得探索可用作生物技術(shù)宿主的高效微生物。” “此外，我們的計算探索方法顯示了計算機建模方法在應用中的優(yōu)勢，這些應用需要對生物技術(shù)系統(tǒng)進行生物技術(shù)使用。”
      
			

			
        
      
			
      
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