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      豬的抗菌藥物耐藥性高于歐洲肉雞
      
			
      
				2019-03-15 10:19:07
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      迄今為止，在對生產(chǎn)動(dòng)物進(jìn)行的最大宏基因組學(xué)研究中，丹麥技術(shù)大學(xué)發(fā)現(xiàn)豬的抗菌藥物耐藥性比肉雞更高，但肉雞的耐藥基因種類更多。用抗微生物劑處理動(dòng)物會(huì)導(dǎo)致細(xì)菌變得耐藥，這些抗性細(xì)菌可以通過食物鏈傳播給人類并與動(dòng)物緊密接觸。顯示抗生素抗性存在的位置，類型和數(shù)量的可靠數(shù)據(jù)對于對抗動(dòng)物中的抗性細(xì)菌以及評估旨在限制抗微生物抗性存在的政治舉措的效果是必要的。
      

      豬的抗菌藥物耐藥性高于歐洲肉雞
      

      這就是丹麥通過DANMAP監(jiān)測計(jì)劃監(jiān)測抗生素耐藥性和在生產(chǎn)動(dòng)物和人類中使用抗生素20多年的原因。然而，目前的監(jiān)測方法僅顯示冰山一角，因?yàn)樗鼈兓诜蛛x和生長特定的致病微生物并確定特異性地在這些生物體中發(fā)生抗微生物抗性。
      

      新方法產(chǎn)生了巨大的數(shù)據(jù)集
      

      另一方面，宏基因組測序可以提供更詳細(xì)的抗性程度圖，因?yàn)樵摲椒梢岳L制樣品中的所有DNA材料，而不僅僅是選定的生物體。因此，研究人員可以檢測到生物體中的抗性，而這些物質(zhì)并不存在。
      

      丹麥技術(shù)大學(xué)國家食品研究所的研究人員領(lǐng)導(dǎo)了迄今為止最大的生產(chǎn)動(dòng)物宏基因組學(xué)研究，他們與其他歐洲研究人員一起制定了歐洲豬和肉雞的抗藥性程度和類型。
      

      研究人員使用DTU超級(jí)計(jì)算機(jī)Computerome分析了來自9個(gè)歐洲國家359個(gè)農(nóng)場的9,000多頭豬和肉雞的糞便樣本中的DNA序列。這導(dǎo)致超過5,000億個(gè)DNA核苷酸的測序，相當(dāng)于超過1,500個(gè)人類基因組。
      

      這兩個(gè)眾所周知且令人驚訝的結(jié)果
      

      “正如之前對個(gè)別細(xì)菌種類的研究所見，我們發(fā)現(xiàn)消費(fèi)與抵抗之間存在相關(guān)性。因此，我們不出所料地發(fā)現(xiàn)丹麥和荷蘭農(nóng)場的抗藥性較低，農(nóng)民使用的抗菌藥物數(shù)量低于其他7個(gè)國家。”國家食品研究所的博士后Patrick Munk說。
      

      “然而，令人驚訝的是，雖然我們發(fā)現(xiàn)豬的抗性比肉雞更多，但肉雞的抗性基因存在更大的差異。我們還看到各國之間的抗性譜差異很大，這是由于抗菌藥物使用的差異，細(xì)菌成分的差異以及其他未知因素，“他補(bǔ)充說。
      

      研究人員還能夠利用研究結(jié)果確定選定的，有問題的抗性基因如mcr-1 的擴(kuò)散，這些基因會(huì)導(dǎo)致對抗菌粘菌素的抗性。分析表明，mcr-1最常見于保加利亞和意大利肉雞。
      

      宏基因組研究顯示出很多潛力
      

      與傳統(tǒng)的分析方法不同，宏基因組學(xué)研究的原始數(shù)據(jù)可以在將來重復(fù)使用，以檢驗(yàn)其他問題。隨著研究人員檢測到更多的抗性基因，這將使他們能夠從舊的宏基因組測序研究中回收原始數(shù)據(jù)，以了解這些基因是如何出現(xiàn)和傳播的。
      

      “生產(chǎn)動(dòng)物的宏基因組數(shù)據(jù)的數(shù)字檔案具有重要價(jià)值，因此我們建議除現(xiàn)有的常規(guī)抗藥性監(jiān)測外，還應(yīng)引入基于宏基因組測序的抗性監(jiān)測方法，”Patrick Munk說。
      

      該研究是與歐盟資助的項(xiàng)目EFFORT的同事合作進(jìn)行的。結(jié)果在“ 自然微生物學(xué) ” 雜志的一篇科學(xué)文章中進(jìn)一步詳細(xì)描述：“ 九個(gè)歐洲國家的屠宰豬和肉雞的糞便抵抗組的豐富和多樣性”。
      

      該研究的樣本來自比利時(shí)，保加利亞，丹麥，法國，德國，意大利，荷蘭，波蘭和西班牙。
      
			

			
        
      
			
      
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