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      早期發(fā)散真菌的基因組序列有助于追蹤白腐真菌的起源
      
			
      
				2019-01-23 10:49:33
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      研究人員利用代表早期發(fā)散組的10種白腐病和褐腐病真菌的草圖基因組序列來幫助完善木質(zhì)纖維素分解的酶起源的時(shí)間表。真菌是植物材料的天然降解物，含有生物燃料研究人員希望用于商業(yè)應(yīng)用的酶。通過研究白腐病和褐腐真菌基因組序列中的酶家族，研究人員可以填補(bǔ)真菌進(jìn)化時(shí)間線的空白，并為各種物種獲得分解植物細(xì)胞壁中所有木質(zhì)成分的能力提供更精確的時(shí)間戳。
      

      早期發(fā)散真菌的基因組序列有助于追蹤白腐真菌的起源
      

      生物燃料研究人員對木材腐爛真菌感興趣，因?yàn)樗鼈兊拿缚梢苑纸庵参锊牧?，如纖維素，半纖維素和木質(zhì)素。褐腐真菌通常被描述為只能分解纖維素和半纖維素的那些，而白腐真菌可以分解所有植物細(xì)胞壁成分 - 纖維素，半纖維素和木質(zhì)素。
      

      現(xiàn)有的各種真菌基因組序列也證明了真菌所采用的木材腐爛策略的廣度 ; 例如，雖然一些真菌可能以與白腐病相同的方式分解植物物質(zhì)，但它們?nèi)鄙僖恍┩ǔＥc白腐真菌相關(guān)的基因家族。在2016年4月出版的“ 分子生物學(xué)與進(jìn)化”雜志上發(fā)表的一項(xiàng)研究中來自美國能源部聯(lián)合基因組研究所(DOE JGI)的研究人員，DOE科學(xué)用戶設(shè)施辦公室，與法國國家研究所INRA和馬薩諸塞州克拉克大學(xué)的合作者，在10種真菌的幫助下進(jìn)行了比較基因組學(xué)分析。由DOE JGI測序，組裝和注釋，以便更好地重建木質(zhì)素降解真菌酶的來源。
      

      這項(xiàng)工作建立在2012年科學(xué)研究的基礎(chǔ)上，DOE JGI和克拉克大學(xué)的研究人員提出，大約3億年前白腐真菌的演化恰好與成煤石炭紀(jì)時(shí)期結(jié)束，影響了全球碳循環(huán)。該分析不包括幾組早期分化真菌的基因組序列，其中一些包括暗示白腐病進(jìn)化甚至可能更早發(fā)生的物種。
      

      隨著草案基因組現(xiàn)在代表早期發(fā)散的真菌，更精確的分析顯示“白腐真菌使用的大部分氧化酶多樣性已經(jīng)出現(xiàn)在第一個(gè)白腐病種的起源之后”，這一發(fā)現(xiàn)增加了對早先的報(bào)道。除了澄清真菌生物質(zhì)降解酶進(jìn)化之外，這些額外的真菌基因組還鑒定了生物能研究人員可能感興趣的其他候選降解酶。
      
			

			
        
      
			
      
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