修復30億年的遺傳錯誤可以顯著改善基因測序
校的研究人員開發(fā)了一種修復方法,可以讓RNA首次準確校對。這項于6月23日發(fā)表在“ 科學 ”雜志上的新發(fā)現將提高基因研究的精確度,并可以根據個人的基因構成顯著改善醫(yī)學。某些稱為逆轉錄病毒的病毒可導致RNA復制DNA,這一過程稱為逆轉錄。眾所周知,這一過程容易出錯,因為所有病毒的進化祖先都無法準確復制遺傳物質。
在UT Austin設計的新創(chuàng)新是一種可以進行逆轉錄的酶,但也可以在復制遺傳密碼時“校對”或檢查其工作。該酶首次允許以接近完美的精確度復制大量RNA信息。“我們創(chuàng)造了一組新的酶,能夠以前所未有的精確度讀取活細胞內的遺傳信息,”UT奧斯汀系統(tǒng)與合成生物學中心的博士后研究員Jared Ellefson說。“在進化過程中,我們的酶可以在復制RNA時糾正錯誤。”
逆轉錄主要與逆轉錄病毒如HIV有關。在自然界中,這些病毒無法準確地復制DNA可能有助于在一段時間內創(chuàng)造物種的多樣性,從而導致我們所知道的生命的復雜性。
自發(fā)現逆轉錄以來,科學家們利用它來更好地了解與遺傳性疾病和人類健康其他方面有關的遺傳信息。然而,現有RNA測序的容易出錯的性質對科學家來說是一個問題。“通過校對,我們的新酶可提高RNA測序的精確度和保真度,”Ellefson說。“如果沒有忠實讀取RNA的能力,我們就無法準確確定細胞的內部運作。這些錯誤可能導致研究實驗室的誤導數據和臨床實驗室中潛在的誤診。”
Ellefson和研究團隊使用定向進化技術設計了這種新酶,以培養(yǎng)高保真(校對)DNA聚合酶以使用RNA模板。這種名為RTX的新酶在復制RNA的同時保留了高度準確和高效的校對功能。準確度至少提高了三倍,準確度可高達10倍。這種新酶可以增強從細胞中讀取RNA的方法。
“當我們走向個性化醫(yī)療時代,每個人的成績單都會像讀脈沖一樣容易讀出,序列信息的準確性將變得越來越重要,”分子生物科學教授安迪艾靈頓說。“這一點的重要性在于,我們現在還可以復制現代基因組中發(fā)現的大量RNA信息,這些信息以RNA轉錄本的形式編碼,幾乎可以編碼我們生理學的每個方面。這意味著根據基因組信息進行的診斷更多可能是準確的。“
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