科學(xué)家對(duì)眼鏡猴基因組進(jìn)行測序
今天,來自美國和德國的一個(gè)國際研究小組報(bào)告對(duì)菲律賓眼鏡猴的基因組進(jìn)行了測序和注釋。該團(tuán)隊(duì)的結(jié)果將眼鏡猴放在靈長類動(dòng)物進(jìn)化樹的一個(gè)重要分支上 - 沿著同一個(gè)分支導(dǎo)致人類,猴子和類人猿。
眼鏡猴屬于這個(gè)擁有4500萬年歷史的家庭Tarsiidae。它們是小型的夜間靈長類動(dòng)物,與其假定的姐妹家族一起滅絕的Omomyidae,曾在亞洲,歐洲和北美洲廣泛分布,但今天只在東南亞島嶼居住。
眼鏡猴家族至少有10種現(xiàn)存物種,分別存在于婆羅洲的印度尼西亞和馬來西亞部分,印度尼西亞的蘇拉威西島,蘇門答臘島和爪哇島以及大棉蘭老島和菲律賓南部的周邊島嶼。
眼鏡猴是以大眼睛和耳朵為特征的樹棲靈長類動(dòng)物。他們的腿和腳適應(yīng)突然,強(qiáng)大的跳躍,有一個(gè)細(xì)長的踝骨,t骨,他們被命名。這些解剖學(xué)專業(yè)允許眼鏡猴有效地探測和猛撲獵物。
眼鏡猴是世界上最具食肉性的靈長類動(dòng)物,它們?cè)谡麄€(gè)地理范圍內(nèi)通常都是食蟲性的,有些人觀察到以小鳥,嚙齒動(dòng)物和蜥蜴為食。
這種飲食需要高度專業(yè)化的視覺和聽覺適應(yīng)性來檢測昆蟲運(yùn)動(dòng)和捕獲隱秘的獵物。例如,眼鏡猴的眼睛質(zhì)量幾乎是其大腦質(zhì)量的兩倍,頭骨的形態(tài)反映了支撐一對(duì)肥厚眼睛所需的修飾。
靈長類動(dòng)物中眼鏡猴的位置一直被認(rèn)為是有爭議的。
他們的牙齒和下顎更類似于“濕鼻子”靈長類動(dòng)物,如狐猴,但它們的眼睛和鼻子更類似于“干鼻”靈長類動(dòng)物,如猴子和人類。
通過測序菲律賓眼鏡猴(Tarsius syrichta)的完整基因組,這是菲律賓特有的一種眼鏡猴,由華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院科學(xué)家Wesley Warren領(lǐng)導(dǎo)的研究小組明確地將眼鏡猴放入了干鼻子類別。
“我們對(duì)眼鏡猴進(jìn)行測序不僅是為了確定它們適合靈長類動(dòng)物的進(jìn)化,還因?yàn)樗鼈兊纳恚馄屎蛿z食行為非常獨(dú)特,”沃倫博士說。
研究小組分析了稱為轉(zhuǎn)座子或“跳躍基因”的DNA序列,它們可以從基因組的一部分跳到另一部分,通常在這個(gè)過程中自我復(fù)制。隨著時(shí)間的推移,轉(zhuǎn)座子失去了跳躍的能力。
科學(xué)家比較了眼鏡猴,人類,布什巴比(濕鼻子靈長類動(dòng)物)和松鼠猴(干鼻靈長類動(dòng)物)的轉(zhuǎn)座子家族。眼鏡猴與松鼠猴和人類分享了最近的轉(zhuǎn)座子家族,只有最年長的有野蠻人的家庭,表明眼鏡猴屬于干鼻靈長類動(dòng)物。
“通過分析跳躍元素,我們可以了解自己的進(jìn)化。這些跳躍基因是可以復(fù)制自身并在基因組中占據(jù)新位置的DNA片段,“該研究的主要作者,德國明斯特大學(xué)的JürgenSchmitz博士說。
“就像在人類中一樣,這些跳躍基因構(gòu)成了眼鏡猴中大約一半的遺傳物質(zhì)。由于眼鏡猴基因組的可用性,有可能檢測到可追溯到的跳躍基因的整合。“
擁有完整的眼鏡猴基因組也使團(tuán)隊(duì)能夠研究使眼鏡猴獨(dú)特的基因。
通過將來自眼鏡猴的基因序列與來自其他靈長類動(dòng)物的基因序列進(jìn)行比較,研究人員發(fā)現(xiàn)192個(gè)基因的變化速度比其他靈長類動(dòng)物更快或更慢。這些基因可能與眼鏡猴的不尋常特征有關(guān)。
該團(tuán)隊(duì)隨后掃描了科學(xué)文獻(xiàn),以確定與這些基因相關(guān)的人類疾病,并發(fā)現(xiàn)了47種疾病。大約四分之一與視力有關(guān),另外四分之一與肌肉骨骼問題有關(guān)。
“表現(xiàn)出獨(dú)特變化的眼鏡猴基因可以為我們提供涉及相同基因的人類疾病的線索,”沃倫博士說。
“如果一種氨基酸已被獨(dú)特改變,并且它與眼鏡猴的新型肌肉組織有關(guān),那么它可能是蛋白質(zhì)的一個(gè)重要組成部分,值得與人類疾病聯(lián)系起來。”
對(duì)眼鏡猴基因組的分析也表明這些動(dòng)物正在顯示出人口下降的跡象。
“我們認(rèn)為人口規(guī)模在下降而不是反彈。大多數(shù)的下降是由于棲息地的喪失,但寵物貿(mào)易也有所貢獻(xiàn),“沃倫博士說。
研究人員希望從其他物種和種群中獲取DNA,他們計(jì)劃用它來評(píng)估眼鏡猴種群的健康狀況,以及其他研究。
“如果我們能夠?qū)ζ渌坨R猴的基因組進(jìn)行測序,我們就可以測量種群多樣性。擁有更多多樣性的人群應(yīng)該能夠更好地維持其環(huán)境的變化,“沃倫博士說。
“這將有助于我們確定他們真正的瀕危程度,以便我們能夠采取措施更好地保護(hù)他們。”
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