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      一項新研究揭示了甜瓜基因組的基因組結(jié)構(gòu)
      
			
      
				2019-10-28 16:23:33
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      來自意大利和西班牙的遺傳研究人員團(tuán)隊已完成對七個甜瓜品種基因組的首次全面分析。
      

      科學(xué)家們證明，高度栽培和育種的品種顯示出最少的多樣性，而野生瓜種類最多。
      

      他們的研究在線發(fā)表在《分子生物學(xué)與進(jìn)化》雜志上，描述了超過430萬個單序列DNA變異體，以及許多重要的結(jié)構(gòu)變異體，包括缺失，倒位，重復(fù)和移動元件運(yùn)動。
      

      一項新研究揭示了甜瓜基因組的基因組結(jié)構(gòu)
      

      研究資深作者何塞普·瑪麗亞·卡薩庫伯塔博士說：“這項研究揭示了瓜類基因組的高度可塑性，為將來進(jìn)行分析以解決瓜類育種目標(biāo)鋪平了道路，例如提高果實(shí)的質(zhì)量或?qū)Σ∠x害的抵抗力。”來自西班牙巴塞羅那農(nóng)業(yè)基因組學(xué)研究中心。
      

      “從更廣泛的角度來看，將需要進(jìn)行此類研究來育種新的植物品種，以應(yīng)對農(nóng)業(yè)挑戰(zhàn)，包括人口增長，土地和水的短缺以及氣候變化的未來影響。”
      

      總體而言，Casacuberta博士及其合作者發(fā)現(xiàn)了902個可能受DNA結(jié)構(gòu)變異影響的基因，其中53個基因被認(rèn)為與疾病抗性(29)，細(xì)胞壁代謝(10)，香氣揮發(fā)物代謝(9)，糖代謝( 4)和類胡蘿卜素的生物合成(1)。
      

      在最近的甜瓜進(jìn)化過程中，稱為轉(zhuǎn)座子的移動元件即基因跳躍結(jié)構(gòu)非?；钴S，該研究報告了許多可能與重要農(nóng)藝性狀的變異相關(guān)的轉(zhuǎn)座子插入，即使是在兩個密切相關(guān)的優(yōu)良品系之間。
      

      “在代表物種多樣性并包括野生種和高品系的7個瓜品種中發(fā)現(xiàn)的變異性相對較高，部分原因是某些譜系的顯著差異。多樣性在整個基因組中分布不均勻，在染色體的末端較低，而在著絲粒附近區(qū)域較高，這與純化功能區(qū)域上的選擇和重組力的效果兼容。此外，在精英品種中，這種變異性大大降低了，這可能是由于育種過程中的選擇所致。”
      

      “我們發(fā)現(xiàn)一些染色體區(qū)域顯示出精英品種與其他品種的高度差異，可以將其視為強(qiáng)烈選擇的候選區(qū)域。”
      

      “我們的數(shù)據(jù)還表明，轉(zhuǎn)座子和SV可能是瓜子變異性的重要組成部分，這突出了分析所有類型的遺傳變異性以了解作物基因組進(jìn)化的重要性。”
      
			

			
        
      
			
      
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