研究人員根據(jù)四種管理策略進行新型小麥微生物組分析
不同的作物管理策略可以對作物及其產(chǎn)量產(chǎn)生各種顯著影響。但微生物水平的影響是什么......不僅在根部而且在整個植物中?
分子生物學(xué)家Kristi Gdanetz和密歇根州立大學(xué)的Frances Trail試圖回答這個問題,在四種常見的管理策略下開發(fā)了對小麥微生物組的描述性分析:常規(guī),免耕,有機和減少化學(xué)投入。
他們的分析和數(shù)據(jù)最近發(fā)表在完全開放獲取的期刊Phytobiomes上,可供學(xué)術(shù)和行業(yè)研究人員免費獲取,研究植物微生物組及其在減少疾病或提高作物產(chǎn)量方面的作用。
他們的研究是在一個獨特而理想的土地上進行的,用于研究在所有四種管理策略下對小麥相關(guān)微生物的影響。24個一英畝的管理地塊隨機分散在一個較大的田地中,每個地塊的管理方式與小麥 - 玉米 - 大豆作物輪作的一部分相同,在MSU凱洛格生物站進行了20多年,國家科學(xué)基金會長期生態(tài)研究項目的一部分。
在生長季節(jié)的不同階段,Gdanetz和Trail從每個不同管理地塊種植的小麥中收集了200多個葉,莖和根的樣本。然后使用高通量擴增子測序處理樣品以鑒定微生物群落。還從樣品中開發(fā)了微生物培養(yǎng)物收集品,為分離和培養(yǎng)特定的微生物類群提供了寶貴的資源。
然后從樣品中分離出生活在植物內(nèi)的特定內(nèi)生菌或微觀真菌,并測試對禾谷鐮刀菌(Fusarium graminearum)的生物防治活性,鐮刀菌是一種已知導(dǎo)致鐮刀菌枯萎病的病原體,是一種經(jīng)濟破壞性的小麥病。這部分工作由密歇根小麥計劃資助。
“大多數(shù)研究只關(guān)注與植物相關(guān)的根和根際微生物,”Gdanetz說。“但我們不斷獲得證據(jù)表明地上微生物群落在植物健康中具有重要作用。”
結(jié)果表明,微生物群落受小麥植物器官和年齡的強烈影響,也可能受到管理策略的影響。
“操縱植物相關(guān)微生物以減少疾病或提高作物產(chǎn)量需要徹底了解植物生物體內(nèi)的相互作用,”Gdanetz說。“我們?yōu)槿藗兲峁┝艘恍┗A(chǔ)數(shù)據(jù),用于生成合成微生物組,用于實驗操作。”
“我們還希望看到在美國其他現(xiàn)場進行的類似研究,以確定我們觀察到的這些模式是否會成立,”Gdanetz說。
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