研究人員設計出新的方法來辨別微生物的食用方式
北卡羅來納州立大學和卡爾加里大學的研究人員設計的一項新技術,可以更深入地了解微生物群落中的新陳代謝和生理學 - 微生物,如細菌,病毒和我們體內(nèi)的其他微小生命形式。整個自然。具體而言,新技術提供了更直接的方式來確定某種微生物消耗的食物來源或基質(zhì)。
研究人員使用質(zhì)譜儀以非常高的精度測量來自社區(qū)微生物的分子質(zhì)量。然后他們使用新開發(fā)的軟件程序,允許他們將微生物與其底物連接起來。
連接微生物和底物的基礎是所謂的碳穩(wěn)定同位素比 - 天然存在形式的碳與不同質(zhì)量之間的比率。大自然包含碳-12(最豐富的形式)和碳-13(碳-13)比碳-12還多一個中子。每種材料具有這兩種同位素的非常特定的比例,其基本上可以用作材料的指紋或特征。新算法將給定環(huán)境中可用于微生物的底物的碳同位素比率與微生物本身中發(fā)現(xiàn)的比率聯(lián)系起來。
Manuel Kleiner是植物和微生物生物學系的NC州助理教授,也是報告該研究的論文的通訊作者,他說,理解微生物群落對于更好地理解動植物健康和疾病以及重要的環(huán)境過程是必要的。例如土壤和海洋中有機物的分解和養(yǎng)分循環(huán)。
“我們的方法基于你所吃的概念,”克萊納說。“如果有一個具有特定同位素特征的食物來源,我們發(fā)現(xiàn)具有相同特定同位素特征的微生物,我們可以將兩者聯(lián)系起來??脊湃祟悓W家實際上使用了類似的技術,他們可以確定飲食的類型一個人通過分析頭發(fā)或骨頭碎片的同位素比率來吃東西。“
人發(fā)對于工作技術至關重要??巳R納在理發(fā)后將頭發(fā)包裹起來讓他的理發(fā)師感到驚訝。
“我們必須通過使用校準標準來校正質(zhì)譜過程中發(fā)生的某些錯誤。事實證明,人發(fā)是校準儀器的絕佳材料,”Kleiner說。
為了測試新算法,研究人員采集了20個純培養(yǎng)樣品,并顯示該軟件提供的測量結(jié)果與質(zhì)譜標準一致。研究人員還將具有不同微生物的復雜樣本放在一起,并測試復雜社區(qū)內(nèi)不同物種的個體特征。最后,研究人員研究了一種無腸海洋蠕蟲,它攜帶許多細菌,并使用該軟件測試這種共生關系的代謝。
Kleiner補充說,該研究的所有數(shù)據(jù)都是公開的,因此其他研究人員可以測試和使用新軟件。
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