進(jìn)入真菌內(nèi)生真菌的窗口
研究人員對橡膠樹的真菌內(nèi)生菌進(jìn)行了測序,并將其基因組與36種其他真菌進(jìn)行了比較,重點(diǎn)關(guān)注對宿主 - 真菌相互作用至關(guān)重要的基因。內(nèi)生菌存在于活的植物細(xì)胞內(nèi),不僅可以在植物健康中發(fā)揮作用,而且可以在碳和氮循環(huán)中發(fā)揮作用。了解內(nèi)生生活方式的演變可以幫助研究人員了解植物和真菌如何形成共生關(guān)系,以及共生關(guān)系如何為寄主植物提供有益的特性。
內(nèi)生菌是非常常見地存在于活植物細(xì)胞內(nèi)而不傷害其宿主的生物,并且實(shí)際上通常對其生存和生理有顯著貢獻(xiàn)。內(nèi)生真菌的演變和它們與宿主相互作用的機(jī)制仍然知之甚少。為了深入了解這些問題,包括美國能源部聯(lián)合基因組研究所(DOE JGI)研究員,美國能源部科學(xué)用戶設(shè)施辦公室和克拉克大學(xué)長期合作者在內(nèi)的研究小組對Xylona heveae的基因組進(jìn)行了測序,這是一種內(nèi)生菌。秘魯橡膠樹,然后將其基因組與子囊菌門內(nèi)36種相關(guān)真菌的基因組進(jìn)行比較。
基于37個真菌基因組的數(shù)據(jù)集,其中三分之一在DOE JGI進(jìn)行測序和注釋,該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)內(nèi)生菌如X. heveae,以避免觸發(fā)其植物宿主的免疫系統(tǒng),通過減少其CAZymes進(jìn)行調(diào)整,編碼碳水化合物活性酶的纖維素降解基因。與此同時,真菌內(nèi)生菌似乎也擴(kuò)大了可以提高其在宿主植物細(xì)胞間隙內(nèi)存活機(jī)會的酶數(shù)量。
作者認(rèn)為,在適應(yīng)宿主的過程中,X。heveae已經(jīng)降低了木材降解能力,以至于它可能無法轉(zhuǎn)換為不同的生活方式,也不會致病。他們還提出這種真菌內(nèi)生菌可以通過昆蟲傳播。該報(bào)告發(fā)表在2016年1月的Fungal Biology上。
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