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      改善古生物基因組學(xué)
      
			
      
				2018-12-21 11:04:04
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      脆弱的DNA分子容易受到損害，并且隨著時間的推移會被不相關(guān)的DNA污染。DNA序列的標準方法是首先擴增微小的DNA樣本。然而，從未經(jīng)過保存的DNA樣品中提取的古老的DNA 1通常難以測序，因為它已經(jīng)屈服于這些侮辱。
      

      改善古生物基因組學(xué)
      

      由丹麥哥本哈根大學(xué)Ludovic Orlando領(lǐng)導(dǎo)的國際研究團隊，包括沙特阿拉伯沙特國王沙特大學(xué)的Khaled Al-Rasheid，報道了古??老DNA的第一個真正的單分子測序。
      

      真正的單分子測序(tSMS)是一種繞過DNA擴增的最先進技術(shù)。它允許對單鏈DNA進行測序，這使得它比標準方法更快。
      

      奧蘭多和他的同事們從永久凍土中保存的馬骨中采集了DNA樣本超過5萬年，并使用tSMS生成了115.9兆堿基。他們在基因組研究中發(fā)表了他們的發(fā)現(xiàn) 。
      

      然后，該團隊采用標準測序方法從相同樣品中產(chǎn)生76.9兆堿基，并比較兩種技術(shù)產(chǎn)生的序列。
      

      他們證實標準方法可以從古代DNA中產(chǎn)生可靠的序列，但是用tSMS獲得了更高的序列產(chǎn)量，因為這種方法特別適合于對極短片段進行測序。
      

      研究人員對tSMS方案進行了簡單的修改，使馬DNA的比例增加了三倍，從而污染了DNA。
      

      化石骨的某些部分比其他部分含有更多的DNA，并且在采集了幾個不同的樣本后，該團隊能夠識別富含DNA的利基。這可以使未來研究中更容易從化石骨骼中提取更多古老的DNA。
      

      研究人員建議，結(jié)合標準和尖端技術(shù)，每種技術(shù)都針對單個樣品的特性進行定制，這將使古代DNA樣品的測序具有前所未有的準確性。
      

      “我們可以進一步改善古代DNA的tSMS，”Ludovic說，“通過利用酶處理來獲取當前協(xié)議遺漏的分子。”
      
			

			
        
      
			
      
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