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      香蕉基因組測(cè)序
      
			
      
				2018-12-14 21:34:46
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      一個(gè)由植物科學(xué)家組成的國(guó)際聯(lián)盟已經(jīng)完成了香蕉基因組的第一次測(cè)序。
      

      香蕉基因組測(cè)序
      

      發(fā)現(xiàn)香蕉基因組含有超過(guò)36,000個(gè)基因，略高于人類基因組。結(jié)果發(fā)表在Nature雜志上。
      

      “我們正在處理大量信息，”共同作者，亞利桑那大學(xué)植物科學(xué)學(xué)院助理教授Eric Lyons博士說(shuō)。“植物基因組具有令人難以置信的動(dòng)態(tài)，這使它們成為最令人著迷的同時(shí)也是最難研究的生物體。”
      

      在許多品種的香蕉中，其學(xué)名是Musa acuminata，一種名為DH-Pahang的品種因其對(duì)疾病的易感性而聞名，使其成為一種糟糕的作物選擇。DH-Pahang在農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)的支持下，由兩家法國(guó)研究機(jī)構(gòu)CIRAD和CEA-Genoscope領(lǐng)導(dǎo)的測(cè)序團(tuán)隊(duì)為該項(xiàng)目選擇了該品種，從而成為明星。
      

      DH-Pahang香蕉與其親屬的不同之處在于它具有遺傳學(xué)家所謂的純合基因組。
      

      “這意味著每個(gè)染色體的兩個(gè)拷貝都是相同的，”Lyons博士解釋說(shuō)。“使用純合子基因組可以更容易地解決基因組的拼圖并正確地組裝所有部分。你不會(huì)因?yàn)榛蚪M中的基因等位基因具有略微不同的拼圖或序列而感到困惑。“
      

      根據(jù)該財(cái)團(tuán)的說(shuō)法，香蕉對(duì)南方國(guó)家4億多人的食物和經(jīng)濟(jì)安全至關(guān)重要，但它們受到一系列寄生蟲的持續(xù)壓力。生產(chǎn)我們?cè)诔兄邪l(fā)現(xiàn)的“出口”香蕉的種植園的壓力特別大。這使得開發(fā)新的，更具抗性的品種變得至關(guān)重要，盡管由于栽培香蕉品種的肥力非常低，這是一項(xiàng)復(fù)雜的操作。
      

      新近獲得的基因組序列提供了對(duì)植物每個(gè)基因及其11個(gè)染色體上的位置的訪問(wèn)。該聯(lián)合會(huì)在一份聲明中表示，這種知識(shí)將使識(shí)別負(fù)責(zé)抗病性和果實(shí)品質(zhì)等性狀的基因變得更加容易。最后，它將成為利用全世界許多遺傳資源改善香蕉品種的重要工具。
      

      香蕉是其植物類中的第一種非草生植物，即單子葉植物，其整個(gè)基因組已被測(cè)序。Monocots包括草，棕櫚，百合和其他多數(shù)肉質(zhì)的植物。另一方面，Dicots包含更多進(jìn)化的近期植物，包括大多數(shù)開花植物和所有真樹。
      

      “香蕉是我們測(cè)序的第一個(gè)單子葉植物基因組，它不是來(lái)自谷物，”里昂博士說(shuō)。“這給了我們一個(gè)很好的機(jī)會(huì)來(lái)將這個(gè)群體與其遠(yuǎn)親進(jìn)行比較，并更好地了解單子葉植物譜系的演變。”
      

      研究人員已經(jīng)能夠確定香蕉已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了三次完整的基因組重復(fù)事件，其中至少有兩次與草中的情況無(wú)關(guān)。與動(dòng)物王國(guó)不同，復(fù)制整個(gè)基因組在植物世界中并不罕見。
      

      “我們有時(shí)會(huì)開玩笑說(shuō)，一旦你給植物一個(gè)有趣的外觀，它就會(huì)使整個(gè)基因組翻倍，”里昂斯博士說(shuō)。
      

      這種被稱為多倍體的現(xiàn)象是植物基因組對(duì)像Lyons博士這樣的科學(xué)家提出挑戰(zhàn)的主要原因之一，Lyons博士有興趣了解基因組如何在進(jìn)化時(shí)間內(nèi)發(fā)生變化并將其與生物體的功能聯(lián)系起來(lái)。
      
			

			
        
      
			
      
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