蜥蜴基因組測(cè)序
來(lái)自德國(guó)和美國(guó)的一個(gè)國(guó)際研究小組對(duì)巨型tegu(Salvator merianae)的基因組進(jìn)行了測(cè)序,該巨型tegu(也稱為黑色和白色tegu)是一種南美蜥蜴,具有自己的加熱系統(tǒng)。
“大多數(shù)爬行動(dòng)物不能像哺乳動(dòng)物一樣控制體溫,而必須依靠其環(huán)境來(lái)達(dá)到最佳體溫,” 德國(guó)馬克斯普朗克分子細(xì)胞生物學(xué)和遺傳學(xué)研究所的團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人Michael Hiller博士說(shuō)。合著者。
“然而,tegu已向邁向全面溫血的方向邁出了一步 - 這只蜥蜴可以將自己的體溫升高到高于周圍環(huán)境10攝氏度。”
“雖然它是南美洲雨林和熱帶稀樹(shù)草原的土生土長(zhǎng),但它的魅力本質(zhì) - 它甚至可以達(dá)到一定程度的房屋訓(xùn)練 - 使它成為極其迷人的寵物,深受爬行動(dòng)物愛(ài)好者的喜愛(ài)。”
“不幸的是,國(guó)際貿(mào)易是物種進(jìn)入新環(huán)境的主要原因之一,在那里它們可能成為本地物種的威脅。”
“考慮到tegu獨(dú)特的生物學(xué)特性及其對(duì)環(huán)境的潛在危險(xiǎn),這種大型蜥蜴的極高質(zhì)量基因組序列的可用性是識(shí)別和分析這些方面的潛在分子基礎(chǔ)的豐富資源。”
為了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo),Hiller博士及其同事使用最先進(jìn)的技術(shù)來(lái)讀取tegu的DNA并組裝其基因組序列。
在新發(fā)布的tegu基因組序列是兩個(gè)以上的十億DNA字母,并包含22413個(gè)編碼基因,其中16,995(76%)有可能有人類的直系同源基因。
“與其他爬行動(dòng)物類似,tegu基因組的很大一部分由重復(fù)序列組成,這些序列在基因組中多次出現(xiàn),”研究人員說(shuō)。
“重復(fù)是組裝基因組時(shí)的主要問(wèn)題,特別是當(dāng)重復(fù)序列長(zhǎng)于序列DNA片段的長(zhǎng)度時(shí),會(huì)導(dǎo)致組裝中出現(xiàn)間隙(斷裂)。”
“它是迄今為止任何爬行動(dòng)物基因組中最完整的組裝,也將幫助我們研究其他蜥蜴和蛇,”他們總結(jié)道。
該結(jié)果顯示在該雜志GigaScience。
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