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      據(jù)報(bào)道RNA測序技術(shù)發(fā)展得更快更便宜
      
			
      
				2019-04-20 09:00:45
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      來自洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院(EPFL)生物工程研究所的Bart Deplancke博士實(shí)驗(yàn)室的研究人員稱，他們開發(fā)了一種名為Bulk RNA Barcoding and sequencing(BRB-seq)的新方法，其價(jià)格比傳統(tǒng)商業(yè)便宜25倍RNA測序技術(shù)。
      

      據(jù)報(bào)道RNA測序技術(shù)發(fā)展得更快更便宜
      

      科學(xué)家指出，BRB-seq具有許多優(yōu)點(diǎn)，可快速保留鏈特異性。因此，BRB-seq提供了一種低成本的方法，用于在數(shù)百個(gè)RNA樣本上進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)，這可以在一次運(yùn)行中增加生物學(xué)重復(fù)的數(shù)量(因此實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)確性)，Deplancke解釋說，他的團(tuán)隊(duì)的工作(“ BRB-” seq：通過大量RNA條形碼和測序?qū)崿F(xiàn)的超可負(fù)擔(dān)的高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué) “在Genome Biology中出現(xiàn)。
      

      在性能方面，科學(xué)家發(fā)現(xiàn)BRB-seq可以在相同的測序深度檢測到與商業(yè)技術(shù)相同數(shù)量的基因，即使使用低質(zhì)量的RNA樣本，該技術(shù)也能產(chǎn)生可靠的數(shù)據(jù)。此外，根據(jù)Deplancke的說法，它產(chǎn)生的全基因組轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的成本與使用RT-qPCR分析四種基因的成本相當(dāng)，RT-qPCR目前是一種標(biāo)準(zhǔn)的低通量方法，用于測量基因表達(dá)。
      

      在測試中，BRB-seq可以生成每天最多192個(gè)樣品的即用型基因組文庫，只需要兩個(gè)小時(shí)的實(shí)際操作時(shí)間。該技術(shù)與用于預(yù)處理和分析測序數(shù)據(jù)的管道相結(jié)合，據(jù)報(bào)道允許在一天內(nèi)獲得結(jié)果。
      

      “自發(fā)布以來，已有數(shù)十家實(shí)驗(yàn)室和公司與我們聯(lián)系，幫助他們實(shí)施BRB-seq方法，”Deplancke說。“由于BRB-seq的低成本，這些研究人員意識到他們現(xiàn)在可以用相同的預(yù)算分析更多的樣品，從而大大增加了他們實(shí)驗(yàn)的范圍和可重復(fù)性。因此，我們預(yù)計(jì)BRB-seq或類似方法將在任何分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室中成為標(biāo)準(zhǔn)，并取代RT-qPCR作為第一個(gè)基因表達(dá)譜分析選項(xiàng)。
      
			

			
        
      
			
      
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