新方法允許分析來自組織的單個神經(jīng)元
瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家開發(fā)出一種新技術(shù),使他們能夠從組織中分離出單個神經(jīng)元并分析其中的基因表達。這項研究發(fā)表在Nature Communications上,展示了神經(jīng)科醫(yī)生如何利用這種方法來區(qū)分可能表現(xiàn)出與疾病不同的密切相關(guān)的神經(jīng)元。該方法還可以對其他領(lǐng)域有價值,例如癌癥研究,病理學(xué)和生物標志物鑒定。
“類似的分析過去需要數(shù)百個,甚至數(shù)千個細胞,”神經(jīng)科學(xué)系的Eva Hedlund說道,他與卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院細胞與分子生物學(xué)系的Qiaolin Deng一起領(lǐng)導(dǎo)了這項研究。“我們的方法學(xué)發(fā)展使我們能夠有效地分析來自人類和小鼠組織的少量細胞,甚至是單個神經(jīng)元。”
識別不同細胞群中基因表達的能力是研究人員理解疾病機制和生物過程的有效工具。他們通常面臨的兩個障礙是缺乏組織材料,尤其是患有不同疾病的患者和細胞群。在許多情況下,沒有可用于鑒定細胞的獨特遺傳標記。因此,需要能夠識別和分析稀缺組織中少量細胞的方法。
KI的團隊現(xiàn)在已經(jīng)結(jié)合了兩種現(xiàn)有方法來開發(fā)一種他們稱之為LCM-seq的新方法。首先,他們使用激光捕獲顯微鏡(LCM)從組織樣本中剖析特定細胞,然后進行深度RNA測序,以研究其中的所有活性基因。
“這項技術(shù)的一大優(yōu)勢是組織不需要被打破,”喬林博士說。“由于這一點,位置信息在每個分離的細胞中保持完整。鑒于我們不必從細胞中純化RNA分子并且可以使用現(xiàn)成的試劑,LCM-seq更簡單,更便宜并且更高重復(fù)性和靈敏度比以前的方法。“
研究人員還表明,LCM-seq可用于更多地了解非常相似的神經(jīng)細胞群。他們研究了從脊髓的不同部位分離的運動神經(jīng)元,這些神經(jīng)元在不治愈的疾病ALS中易于變性,并且檢查了來自帕金森病中被破壞的中腦的不同部分的多巴胺細胞。
“我們證明,我們可以發(fā)現(xiàn)帕金森病易于萎縮的多巴胺細胞與耐藥的多巴胺細胞之間的具體差異,”Hedlund博士說。“由于LCM-seq需要的細胞非常少,因此該技術(shù)可用于其他領(lǐng)域,如癌癥生物學(xué),病理學(xué)和生物標志物鑒定。”
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