研究描述了調(diào)查微生物爆發(fā)的新策略
在微生物學(xué)前沿發(fā)表的一項(xiàng)新研究中,德克薩斯大學(xué)圣安東尼奧分校(UTSA)生物系助理教授Mark Eppinger描述了追蹤致病病原體如大腸桿菌的創(chuàng)新策略。Eppinger希望他的研究能夠幫助制止和預(yù)防大規(guī)模爆發(fā)。“當(dāng)人類致病性大腸桿菌爆發(fā)時(shí),及時(shí)反應(yīng)非常重要,”他說。“通常,起初沒有關(guān)于疾病起源的信息。”
Eppinger是UTSA南德克薩斯州新發(fā)傳染病中心的成員,他稱他在UTSA開發(fā)的方法是一種爆發(fā)菌株的全基因組序列分型。據(jù)研究人員介紹,每次爆發(fā)都具有獨(dú)特的特征。爆發(fā)菌株具有微妙的特征,使其與其他菌株區(qū)別開來,這使得Eppinger可以將它們與其他爆發(fā)進(jìn)行比較和對比。
他將調(diào)查比作看著一輛裝滿同一輛藍(lán)色汽車的停車場。它們看起來非常相似,但是Eppinger正在尋找最小的差異,例如凹痕,劃痕或破碎的尾燈。“沒有細(xì)節(jié)太小,”他說。“我們可以利用這些差異通過觀察這些特征是否存在于同一病原體爆發(fā)的其他病原體中來追蹤疫情的來源。”
發(fā)現(xiàn)爆發(fā)之間的相似性可以將病原體追溯到某個(gè)國家或地區(qū),甚至可以追溯到一個(gè)單一的位置。調(diào)查人員可以更快地找到爆發(fā)的來源,他們可以更快地控制爆發(fā)。
Eppinger的策略還可以幫助確定病原體的致命性。在他的研究中,他專注于大腸桿菌的爆發(fā),大腸桿菌最近影響了像Chipotle這樣的餐館以及銷售冷凍披薩產(chǎn)品的Totino's等公司。“一些爆發(fā)可能比其他爆發(fā)更嚴(yán)重,”他說。“由于2006年爆發(fā)的蔓延通過菠菜蔓延,近半數(shù)受影響的人住院治療,其中很大一部分患有永久性腎臟損害。”
通過用他的技術(shù)研究來自不同過去大腸桿菌爆發(fā)的菌株,Eppinger能夠測量每種菌株產(chǎn)生的毒素的量,這是疾病的直接介導(dǎo),并顯示了由此產(chǎn)生的疾病的嚴(yán)重程度。“就疫情調(diào)查而言,你可以問一個(gè)人他們在哪里吃飯,在哪里工作,以及他們最近是否去過,”Eppinger說。“如果我們得到爆發(fā)菌株,我們可以將其直接映射到其他爆發(fā)菌株并找出原因。答案就在于這些微小的細(xì)節(jié)。”
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