阿拉伯羚羊基因組序列草案
卡塔爾的研究人員繪制了脆弱的阿拉伯羚羊的基因組圖譜。這種羚羊的角矛類似,它在動(dòng)物園和自然保護(hù)區(qū)中幸存下來(lái),在20世紀(jì)70年代被列為滅絕之后。2011年,經(jīng)過(guò)圈養(yǎng)育種計(jì)劃將該物種從邊緣帶回來(lái)后,它僅被國(guó)際自然保護(hù)聯(lián)盟重新歸類為“易受傷害”。
保護(hù)主義者和研究人員希望更好地了解現(xiàn)存羚羊種群的遺傳多樣性,因?yàn)榱缪蛑g數(shù)十年的密集雜交已經(jīng)縮小了遺傳多樣性并威脅了物種的長(zhǎng)期生存。
在這項(xiàng)研究中測(cè)序的基因組是從保存在卡塔爾Al Wabra野生動(dòng)物保護(hù)區(qū)的年輕雄性動(dòng)物中檢索出來(lái)的,證實(shí)了環(huán)保主義者對(duì)遺傳多樣性確實(shí)非常低的擔(dān)憂。
在多哈的卡塔爾威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院開(kāi)展這項(xiàng)工作的首席遺傳學(xué)家喬爾·馬利克(Joel Malek)警告說(shuō),觀察到的低遺傳多樣性可能只在Al Wabra野生動(dòng)物保護(hù)區(qū)的圈養(yǎng)人群中很明顯。唯一可靠的方法是對(duì)來(lái)自其他圈養(yǎng)種群的基因組進(jìn)行測(cè)序。
“這當(dāng)然是我們的下一步,”馬利克說(shuō)。他希望從不同的畜群開(kāi)始測(cè)序至少5-10個(gè)羚羊,以更好地了解遺傳現(xiàn)狀。然而,使第一次基因組作圖特別具有挑戰(zhàn)性的是缺乏任何羚羊基因組參考。
“這是一個(gè)從頭的序列和裝配,需要特殊的DNA庫(kù)和相當(dāng)大的計(jì)算基礎(chǔ)設(shè)施,”他說(shuō)。由于它們具有動(dòng)物基因組的粗略草圖,因此對(duì)其他羚羊的基因組進(jìn)行測(cè)序?qū)⒏尤菀缀捅阋?。雖然第一次測(cè)序成本約為300,000美元,但進(jìn)一步的測(cè)序費(fèi)用僅為10,000美元。
“我們希望盡快開(kāi)始對(duì)它們進(jìn)行排序,但我們正等待有關(guān)各方的資助,”Malek補(bǔ)充道。
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