OGT啟動了用于慢性淋巴細(xì)胞白血病研究的高質(zhì)量NGS小組
牛津基因(OGT)技術(shù),Sysmex令人興奮,集團(tuán)公司宣布發(fā)起的面板SureSeq CLL + CNV -最后一個高質(zhì)量的公司,siguiente-generación命令(NGS)提供研究慢性淋巴細(xì)胞白血病(CLL)。CNV的SureSeq CLL + panel滿足了對每個NGS的拷貝數(shù)(CNV)變異(包括12個三體和雜合子低(LOH))以及體細(xì)胞變異(即使是在較低的等位基因頻率上)的安全檢測的需求。該面板經(jīng)過測試,與軍火庫數(shù)據(jù)顯示出良好的一致性,可以在5-10Mb的低頻率、SNVs (MAF)和等位基因indels中發(fā)現(xiàn)大小CNVs,從10%下降到1% MAF和LOH。
整個面板覆蓋了CLL的所有最新的、基于測試的和基因組畸變基因,并將允許實驗室簡化實驗室工作流程,將多個分析替換為單個分析。
CLL是成人白血病中最常見的類型,與染色體畸變、體細(xì)胞變異、大小CNVs(包括三體)有關(guān)。這種復(fù)雜的遺傳異質(zhì)性,加上缺乏敏感和安全的NGS解決方案,意味著科學(xué)家現(xiàn)在需要使用多種方法來構(gòu)建CLL樣本的基因組譜。
傳統(tǒng)上與NGS作斗爭的一個特別領(lǐng)域是檢測CNVs,這可能發(fā)生在重要的腫瘤抑制基因中,如TP53。通常需要額外的技術(shù),如原位微陣列雜交、核型或熒光(FISH)來發(fā)現(xiàn)這種CNVs和結(jié)構(gòu)異常,如雜合降低(LOH)和三體12。
CNV的SureSeq CLL +小組是與著名的癌癥專家合作設(shè)計的,如OGT執(zhí)行市場營銷人員Emma Shipstone, VP的亮點(diǎn):
經(jīng)驗豐富的癌癥實驗室的投入有助于設(shè)計連接的CNV CLL +面板的SureSeq站點(diǎn)。這是一個很好的CNV檢測,提供了優(yōu)秀的數(shù)據(jù)質(zhì)量。這種分析現(xiàn)在可以取代歷史上對CLL樣本進(jìn)行基因組分析所必需的多次分析。
對于研究人員來說,NGS的單一小組簡化了工作流程,并在單一分析中鞏固了各種基因組變化的輪廓。安全的數(shù)據(jù)分析可以使用流行的、易于使用的解釋軟件OGT進(jìn)行,這是一個強(qiáng)大的、互補(bǔ)的編程解決方案,可以準(zhǔn)確地識別和顯示所有變體,包括CNVs。
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