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      噬菌體是具有雙鏈DNA基因組的小型病毒
      
			
      
				2019-12-25 10:56:36
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      噬菌體是具有雙鏈DNA基因組的小型病毒，與巨型病毒共同感染真核細(xì)胞。幾乎所有已知的噬菌體基因組僅共享四個(gè)共同的基因：主要和次要衣殼蛋白(分別為MCP和mCP)，參與DNA包裝的ATPase和參與衣殼成熟的半胱氨酸蛋白酶PRO。
      

      噬菌體是具有雙鏈DNA基因組的小型病毒
      

      美國(guó)能源部(DOE)聯(lián)合基因組研究所(JGI)，美國(guó)能源部科學(xué)辦公室的研究人員最近在微生物組中進(jìn)行了報(bào)道，他們通過計(jì)算方法將已知的高質(zhì)量噬菌體基因組序列的數(shù)量增加了10倍。通過在JGI的整合微生物基因組和微生物組(IMG / M)數(shù)據(jù)套件(包括IMG / VR(用于病毒)中)中提取超過14,000個(gè)公共宏基因組數(shù)據(jù)集，以用于噬菌體標(biāo)記基因MCP，他們能夠識(shí)別出44,221個(gè)總噬菌體部分序列，包括超過28,000個(gè)唯一的MCP序列。
      

      進(jìn)一步的分析導(dǎo)致鑒定了包含所有四個(gè)核心基因的328個(gè)“高質(zhì)量”(基于完整性)多樣化的新病毒噬菌體基因組。這些噬菌體存在于不同的生境中，包括空氣，植物根際，廢水，甚至是動(dòng)物和人類(首次)腸道，并且在分類學(xué)上分為27個(gè)不同的進(jìn)化枝(其中17個(gè)沒有先前已知的代表)。其中，有89個(gè)重疊群被認(rèn)為是完整的基因組，它們的發(fā)現(xiàn)將可能的噬菌體基因組大小范圍從13.8-29.3千堿基(Kb)擴(kuò)展到10.9-42.3 Kb。此外，基因計(jì)數(shù)也從13-25上升到12-39。研究小組總結(jié)說：“總體而言，我們對(duì)病毒體的多樣性，分布和進(jìn)化進(jìn)行了全球分析。”
      
			

			
        
      
			
      
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