大猩猩揭示了他們的遺傳秘密
由Wellcome Trust Sanger研究所的Chris Tyler-Smith博士和英國劍橋大學(xué)的Aylwyn Scally博士共同領(lǐng)導(dǎo)的一組遺傳科學(xué)家對山地大猩猩(Gorilla beringei beringei)的全基因組進(jìn)行了測序并進(jìn)行了比較以及其他三個大猩猩亞種的基因組–西部低地大猩猩(G. gorilla gorilla),克羅斯河大猩猩(G. g。diehli)和東部低地大猩猩(G. b。graueri)。
大猩猩山發(fā)現(xiàn)于1902年,是東部大猩猩(Gorilla beringei)的一個亞種。與其他東部大猩猩亞種相比,它的頭發(fā),下顎和牙齒更長,但臂稍短。
它是世界上最大的靈長類動物之一,雄性被稱為銀背大猩猩,通常長到雌性大猩猩的兩倍。平均而言,成年男性體重160公斤,成年女性體重98公斤。
山地大猩猩生活在大約10種動物的緊密游牧群體中,由一個占主導(dǎo)地位的雄性來領(lǐng)導(dǎo)和保護(hù)。他們在森林中漫游,尋找莖,葉和芽。
雌性山地大猩猩僅每3-5年生一次,這是一個相對較低的出生率,這是該亞種人口少的一個因素。在30至40年的壽命中,雌性大猩猩可能只有3-8個后代。
這些大猩猩在山地森林和竹林中的高海拔地區(qū)(2,500-4,000 m)被發(fā)現(xiàn)。
它們是從兩個不同的地點(diǎn)得知的:位于剛果民主共和國,盧旺達(dá)和烏干達(dá)邊界的維倫加山脈滅絕的火山山脈,以及烏干達(dá)的布恩迪難以穿越的國家公園。一些科學(xué)家認(rèn)為,布恩迪大猩猩可能是一個單獨(dú)的亞種。
1981年,由于棲息地遭到破壞和狩獵,生活在維龍加火山山脈中的山地大猩猩數(shù)量驟降至253只。從那以后,保護(hù)工作使維龍加族的保護(hù)人數(shù)增加到約480人。
“山地大猩猩是野生動物中研究最深入的靈長類動物之一,但這是第一個深入的全基因組分析,” 《科學(xué)》雜志發(fā)表論文的合著者泰勒-史密斯博士說。
“從對大猩猩參考基因組測序開始的三年后,我們現(xiàn)在可以比較所有大猩猩種群的基因組,包括極度瀕危的山地大猩猩,并開始了解它們的相似性和差異以及近交的遺傳影響。”
泰勒-史密斯博士和他的同事有興趣了解這么小的基因庫將如何影響山地大猩猩,令人驚訝地發(fā)現(xiàn)通過近親繁殖已從種群中去除了許多有害的遺傳變異,并且山地大猩猩在基因上適應(yīng)了小種群的生存人口。
斯卡利博士說:“對大猩猩種群遺傳多樣性和人口歷史的這種新理解為我們提供了關(guān)于猿猴和人類及其近親的近親如何從基因上適應(yīng)小種群生活的寶貴見解。”
“在這些數(shù)據(jù)中,我們可以觀察到通過較小的種群規(guī)模清除基因組嚴(yán)重有害突變的過程。”
利用幾年來收集的血液樣本,研究小組能夠?qū)ζ邆€山地大猩猩的整個基因組進(jìn)行測序。
現(xiàn)在,科學(xué)家們可以看到,這些山地大猩猩以及東部低地大猩猩的遺傳多樣性比中非西部地區(qū)較大群體的大猩猩少了兩到三倍。
盡管人們擔(dān)心這種低水平的遺傳多樣性可能使山地大猩猩更容易受到環(huán)境變化和疾病的影響,包括人類病毒的交叉感染株,但近交在某種程度上對遺傳有益。
在山地大猩猩種群中發(fā)現(xiàn)的有害的功能喪失變異較少,而在西部大猩猩種群中卻較少。
這些變體會阻止基因發(fā)揮作用,并可能導(dǎo)致嚴(yán)重的,常常是致命的健康狀況。
通過分析每個基因組的變異,科學(xué)家們還發(fā)現(xiàn)山地大猩猩已經(jīng)存活了數(shù)千年。
使用最近開發(fā)的方法,他們能夠確定過去一百萬年來人口規(guī)模的變化。
根據(jù)這項研究,幾千年來,山地大猩猩的平均數(shù)量已經(jīng)達(dá)到數(shù)百只。比以前想象的要長得多。
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