基因組考古學家揭示了植物激素的起源
在他們尋求植物中通用生長素激素的起源時,位于瓦赫寧根的生物化學家和生物信息學家接受了考古學家的職務。在大約10億年前,地球上植物生命的進化歷史深處,他們遇到了當時與植物激素有關的蛋白質(zhì)碎片。探索之旅揭示了生命科學家洞察進化的信息,為植物育種者和種植者的前景創(chuàng)造了機會。研究小組于3月27日在領先的在線期刊eLife上發(fā)表了他們的研究結(jié)果。
植物在頂部生長最快,使側(cè)枝和根,葉子轉(zhuǎn)向光,花和果實的各種形式。這些發(fā)展是由植物激素生長素啟動的。生長素在細胞和組織中以不同濃度存在。這使其成為決定植物生長的最復雜的生化系統(tǒng)之一。“令人驚訝的是,這樣一個復雜的系統(tǒng)如何開發(fā)出如此多的過程,就像我們在花卉植物中看到的那樣“研究負責人,瓦赫寧根大學和研究生物化學教授Dolf Weijers教授說,”這包括細胞分裂,細胞生長和分化成各種細胞類型,如芽,葉或果實。最大的謎團是如何通過這個古老的分子實現(xiàn)所有這些反應,以及如何實現(xiàn)這樣一個復雜的系統(tǒng)。
千種植物
博士候選人Sumanth Mutte是Dolf Weijers團隊的成員,研究了超過一千種植物的基因組。他選擇的物種仍然存活,但具有不同的進化生命歷史。這包括“現(xiàn)代”開花植物,這些植物在3.2億年前分裂并且現(xiàn)在具有高度復雜的生長素系統(tǒng):較老的種子植物類型,如針葉樹,以及蕨類植物等孢子植物和早期的蘚類植物,超過5億歲。研究生長素的最古老的生命形式是單細胞綠藻,可追溯到10億年前的深層。
三個早期蛋白質(zhì)家族
“在相當長的一段時間里,植物細胞已經(jīng)發(fā)生了很多變化,”Weijers教授解釋道。“例如,許多基因組增加了一倍或四倍。”這導致大量不同的蛋白質(zhì)在植物中發(fā)揮作用。我們所知的生長素系統(tǒng)已經(jīng)完成了5億年前,當時第一批陸地植物出現(xiàn)了。令我們驚訝的是,我們看到了調(diào)節(jié)生長素功能的三個蛋白質(zhì)家族中的一個,其中一個已經(jīng)存在于綠藻中。十億年前,當生命尚未從水中出現(xiàn)時,我們的追求更加深入,我們的追求使我們成為三個蛋白質(zhì)家族的碎片。我們?nèi)匀辉诮裉斓闹参镏邪l(fā)現(xiàn)它們,但它們起源于綠藻,并且起初可能具有不同的功能。
實驗基因組考古學
博士后研究員Hirotaka Kato隨后通過對來自三個不同時代的植物進行“實驗基因組考古學”驗證了這些發(fā)現(xiàn):藻類,苔蘚和蕨類植物。研究人員通過確定激素打開或關閉的基因數(shù)量,研究了這些基因組如何對生長素產(chǎn)生反應。“這向我們展示了生長素系統(tǒng)如何變得更加復雜,以及植物可以修改哪些成分以使用激素來進行新的過程來調(diào)節(jié)其生長和形狀,”Weijers教授解釋說。
更多關于生長素基本功能的知識本身對生命科學非常重要:植物如何在不同水平,從細胞到器官以及作為一個整體發(fā)揮作用。這些知識可以轉(zhuǎn)化為育種計劃,用于開發(fā)新的糧食作物品種。“更清楚地了解植物如何控制自身的生長和發(fā)育,這使得育種者和后來的種植者能夠提供更健康,更好的作物。”
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