發(fā)現(xiàn)了新的核RNA保留活動(dòng)
基因表達(dá)涉及從其合成位置到發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯的細(xì)胞質(zhì)的mRNA轉(zhuǎn)運(yùn)。然而,許多非編碼RNA物種不遵循這一流程,新數(shù)據(jù)現(xiàn)在證明細(xì)胞如何防止RNA的不需要的輸出,而是確保核降解。
哺乳動(dòng)物的基因組產(chǎn)生了大量的RNAs,它們經(jīng)歷了截然不同的命運(yùn)。蛋白質(zhì)編碼mRNA用作轉(zhuǎn)錄物的原型實(shí)例,其快速加工并從細(xì)胞核輸出到細(xì)胞質(zhì)以翻譯蛋白質(zhì)。然而,幾種RNA,其中許多是非編碼的,通過高度保守的RNA降解機(jī)器RNA外泌體在細(xì)胞核中快速降解。
在最近的工作中,來自Torben Heick Jensen分子生物學(xué)和遺傳學(xué)系實(shí)驗(yàn)室的博士后研究員Toomas Silla發(fā)現(xiàn),廢棄的RNA外泌體功能導(dǎo)致多聚腺苷酸化(pA +)RNA在不同的核灶(pA + foci)中的積累,表明這些累積的RNA被阻止進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)。這暗示了RNA外泌體加載到其底物上所需的所謂的外來體銜接子可能雙重地充當(dāng)RNA核保留因子并抵消出口活性。
此前,Torben Heick Jensen實(shí)驗(yàn)室建立了核外泌體靶向(NEXT)復(fù)合物和PolyA eXosome Targeting(PAXT)連接,成為將RNA外泌體分別與短的未加工或更長的多腺苷酸化RNA連接的銜接子復(fù)合物(Lubas et al.Mol Cell) 2011; Meola等,Mol Cell 2016)。有趣的是,共定位分析顯示,pA +焦點(diǎn)特別富集PAXT蛋白,如MTR4,ZFC3H1和PABPN1。在這些因素中,ZFC3H1似乎對建立pA + RNA病灶至關(guān)重要;在ZFC3H1缺失的細(xì)胞中,沒有形成pA + RNA灶,并且通常在細(xì)胞核中降解的外來體靶被輸出到細(xì)胞質(zhì)中。這些轉(zhuǎn)錄本現(xiàn)在進(jìn)入RNA輸出途徑,
pA + RNA病灶內(nèi)容的轉(zhuǎn)錄組范圍表征令人驚訝地揭示了許多全長和剪接的mRNA。因此,除了真正的RNA外泌體靶標(biāo)之外,mRNA也可能是核衰變的對象。盡管大多數(shù)mRNA在其產(chǎn)生后很快被輸出,但是這些新結(jié)果因此表明mRNA可以從輸出途徑中切除并且在細(xì)胞核中降解。未來的研究將集中在確定如何協(xié)調(diào)生產(chǎn)出口和保留/衰減之間的分類以及哪些其他因素促成這一過程。
科學(xué)文章發(fā)表在國際公認(rèn)的期刊Cell Reports上。
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