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      腫瘤細(xì)胞cohesin在基因組3-D結(jié)構(gòu)中的作用有助于更好地理解腫瘤細(xì)胞
      
			
      
				2019-04-17 11:20:26
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      近年來，顯而易見的是，基因組的空間組織是其功能的關(guān)鍵。這取決于許多因素，包括cohesin蛋白復(fù)合物。這種基本復(fù)合物以兩種形式存在于細(xì)胞中，這兩種形式含有SA1或SA2亞基。西班牙國家癌癥研究中心(CNIO)，基因組調(diào)控中心(CRG)和Centro NacionaldeAnálisisGenómico(CNAG-CRG)的科學(xué)家們已經(jīng)解決了這兩種變體cohesin復(fù)合物的功能特異性。該研究發(fā)表在Nature Structural and Molecular Biology上，深入分析三種基因組結(jié)構(gòu)中兩種變體的功能，并顯示SA2的改變?nèi)绾斡绊懟虮磉_，并可能有利于腫瘤細(xì)胞分化的喪失。
      

      腫瘤細(xì)胞cohesin在基因組3-D結(jié)構(gòu)中的作用有助于更好地理解腫瘤細(xì)胞
      

      為了研究cohesinSA1和SA2的功能，并嘗試了解SA2的缺失如何有利于腫瘤細(xì)胞的生長，作者已經(jīng)使用狀態(tài)對基因組的3-D結(jié)構(gòu)進行了深入的研究。藝術(shù)技術(shù)。
      

      “很難理解腫瘤細(xì)胞是如何存活的，甚至是由于缺乏一種原則上對其活力至關(guān)重要的成分而獲利，”CNIO染色體動力學(xué)組負(fù)責(zé)人，領(lǐng)導(dǎo)者之一Ana Losada說。本文作者。所提及的改變影響SA2變體并且已經(jīng)在各種類型的癌癥中檢測到，例如膀胱癌，尤文肉瘤或急性髓性白血病。
      

      現(xiàn)在已經(jīng)首次報道了SA1和SA2 cohesin變體在基因組組織中的不同作用。“如果不了解cohesin的每個變體的功能，就很難破解它在致癌過程中的作用。這項工作使我們更接近這個目標(biāo)，并且是如何研究三維組織的一個新例子?；蚪M有助于更好地理解和表征基因的調(diào)控，“CNAG-CRG結(jié)構(gòu)基因組學(xué)組負(fù)責(zé)人，該研究的共同領(lǐng)導(dǎo)人Marc A. Marti-Renom說。
      

      在哪里，如何以及為什么?解讀cohesin在3-D基因組中的作用
      

      研究人員分析了每種變體的位置，它們在基因表達中的作用以及基因組的三維組織。“我們已應(yīng)用功能基因組學(xué)來解決兩種cohesin變體的分布，它們在基因組的不同調(diào)控元件中的富集以及它們與基因組組織中涉及的其他因子的共定位，并且我們已經(jīng)詢問了細(xì)胞中基因組的組織。該研究的第一作者，來自CNIO的染色體動力學(xué)小組的Aleksandar Kojic和Ana Cuadrado說，缺少哪一種或另一種變體。
      

      結(jié)果表明，這兩種配合物具有不同的功能。Cohesin-SA1對拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)域的組織非常重要，拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)域構(gòu)成了基因組的全局結(jié)構(gòu)，并且始終與CTCF蛋白一起發(fā)揮作用。然而，cohesin-SA2是不同的：“Cohesin-SA2更具通用性，能夠與多種轉(zhuǎn)錄因子相互作用，形成局部染色質(zhì)環(huán)，將基因組的遠(yuǎn)端功能元件結(jié)合在一起，”Cuadrado說。換句話說，它參與基因表達的調(diào)節(jié)。
      

      這些研究結(jié)果使得作者認(rèn)為“SA2的作用是促進調(diào)節(jié)元件和定義每種細(xì)胞特性的靶基因之間的基因組接觸，”洛薩達說。“我們相信腫瘤細(xì)胞中這種cohesin變異體的缺失會改變它們的特性。重要的是，這些細(xì)胞仍然具有其他的cohesin變體SA1，以使它們存活并進行細(xì)胞分裂。”
      

      “我們的工作與其他CNIO研究人員的結(jié)論一致，即腫瘤細(xì)胞中SA2的突變不會影響細(xì)胞分裂。相反，我們懷疑這種突變會改變細(xì)胞的身份。有必要開始尋找SA2相互作用物，并進行分析。洛杉磯總結(jié)說，哪些關(guān)鍵基因可能受其在腫瘤細(xì)胞中缺失的影響。
      
			

			
        
      
			
      
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