知更鳥和海龜鴿子基因組中的鳥類遷徙和保護(hù)線索
歐洲知更鳥和海龜鴿子的遺傳密碼首次由Wellcome Sanger研究所的科學(xué)家及其合作者進(jìn)行測(cè)序和組裝。今天(12月21日)完成的基因組將使研究人員能夠探索控制鳥類遷徙的基因開關(guān),并深入了解有助于知更鳥“看到”地球磁場(chǎng)導(dǎo)航的磁感受器。海龜鴿子基因組將幫助保護(hù)拯救英國(guó)最快衰落的鳥類之一。
歐洲知更鳥生活在歐洲,俄羅斯和西伯利亞西部。雖然大多數(shù)英國(guó)知更鳥在冬季居住在英國(guó),但一些鳥類將遷移到南歐以在溫暖的氣候下過(guò)冬。同時(shí)在冬季,來(lái)自斯堪的納維亞半島,歐洲大陸和俄羅斯的移民知更鳥前往英國(guó),以避免家鄉(xiāng)的惡劣天氣。
龜鴿也會(huì)遷徙,前往歐洲的繁殖地,并在非洲過(guò)冬。然而,自1995年以來(lái),94%的海龜鴿子已經(jīng)丟失,英國(guó)只剩下不到5,000對(duì)繁殖鴿。龜鴿子是英國(guó)鳥類最快,下降品種,作為一個(gè)結(jié)果,他們被列為脆弱的國(guó)際自然(IUCN)紅色名錄的保護(hù)。
遷移模式和行為因物種而異,但也在物種內(nèi)。同樣,疾病和有限的食物資源等環(huán)境壓力也會(huì)對(duì)各種鳥類產(chǎn)生不同的影響。為了充分了解復(fù)雜性狀的遺傳成分,如遷移和育種,必須閱讀和分析整個(gè)遺傳密碼。
為慶祝桑格25周年,桑格研究所及其合作伙伴閱讀了歐洲知更鳥和海龜鴿子的基因組。
林肯大學(xué)的合作者將知更鳥和海龜鴿子樣本送到劍橋附近的桑格研究所。測(cè)序團(tuán)隊(duì)從樣品中提取DNA,并使用PacBio SMRT測(cè)序技術(shù)生成知更鳥和龜鴿的第一個(gè)參考基因組。
歐洲知更鳥基因組將使研究人員能夠探索支持遷移的基因開關(guān),告訴知更鳥什么時(shí)候離開以及去哪里。知更鳥作為鳥類遷徙模型的作用將有助于了解鳥類眼睛中的磁感受器,使其能夠利用地球的磁場(chǎng)進(jìn)行導(dǎo)航,并解除其他鳥類的遷徙行為。
來(lái)自德國(guó)普蘭馬克斯普朗克進(jìn)化生物學(xué)研究所的Miriam Liedvogel博士說(shuō):“鳥類可以利用地球磁場(chǎng)作為遷徙過(guò)程中的方向參考,鳥類中的磁羅盤首先用知更鳥描述。歐洲知更鳥基因組將使我們能夠識(shí)別驅(qū)動(dòng)鳥類遷徙的原因,并了解其他鳥類遷徙的變異性。“
龜鴿基因組將為確定有效種群規(guī)模和建立育種計(jì)劃提供遺傳參考,以幫助保護(hù)這種受威脅的鳥類。
來(lái)自林肯大學(xué)的Jenny Dunn博士說(shuō):“為了讓鴿子鴿子成為未來(lái)生存的最佳機(jī)會(huì),我們首先需要了解影響其種群數(shù)量下降的壓力。龜鳩基因組將深入了解疾病的方式和有限的糧食資源對(duì)其健康的影響,并將有助于實(shí)際保護(hù)工作,以最大限度地提高引進(jìn)種群的遺傳多樣性。“
歐洲知更鳥和烏龜鴿子加入金鷹,成為25種英國(guó)物種中的第一種,對(duì)其遺傳密碼進(jìn)行測(cè)序和組裝。25個(gè)基因組計(jì)劃包括灰色和紅色松鼠,黑莓和褐鱒等物種。
威爾康桑格研究所副主任朱莉婭威爾遜博士說(shuō):“基因組測(cè)序可以為自然界提供很多東西。遺傳信息可以加強(qiáng)對(duì)受威脅物種的保護(hù),并幫助解開進(jìn)化樹,理解我們共享的物種星球。“
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