研究人員發(fā)現(xiàn)了大多數(shù)常見致命細(xì)菌的危險(xiǎn)菌株
馬里蘭大學(xué)醫(yī)學(xué)院(UM SOM)的一個(gè)多學(xué)科研究小組首次確定了各種大腸桿菌菌株的基因組成,每年大腸桿菌都會(huì)殺死數(shù)十萬人。該論文發(fā)表在最近一期的“ 自然微生物學(xué) ” 雜志上,分析了腸致病性大腸桿菌(EPEC)的DNA ,這是引起腹瀉的細(xì)菌菌株。
由UM SOM基因組科學(xué)研究所(IGS)微生物學(xué)和免疫學(xué)副教授David Rasko博士和UM SOM醫(yī)學(xué)教授Michael Donnenberg領(lǐng)導(dǎo)的科學(xué)家發(fā)現(xiàn),某些菌株通常更致命相對于其它的。結(jié)果將有助于研究人員集中精力識別,治療和潛在控制這些更危險(xiǎn)的版本。這可以更好地了解細(xì)菌究竟是如何造成損害的,最終可以更有效的治療方法,可以顯著降低腹瀉病的死亡率,腹瀉病是全世界兒童死亡的主要原因。每年腹瀉導(dǎo)致大約760,000名五歲以下兒童死亡。它也是五歲以下兒童營養(yǎng)不良的主要原因。在全球范圍內(nèi),有近1個(gè)。
“這些研究結(jié)果確實(shí)有助于我們以一種新的方式繪制細(xì)菌與這些疾病之間的聯(lián)系。幾年前這種研究是不可能的,”拉斯科博士說。“但隨著新進(jìn)展,我們可以做出這些令人興奮的發(fā)現(xiàn)。” 拉斯科將這項(xiàng)研究描述為“基因組流行病學(xué)”,這是一種新的公共衛(wèi)生科學(xué)方法,它將最先進(jìn)的技術(shù)與對致病菌的廣泛了解相結(jié)合,這兩種技術(shù)都存在于馬里蘭大學(xué)醫(yī)學(xué)院。
Rasko博士及其同事,包括岡比亞,馬里,肯尼亞,莫桑比克,印度,巴基斯坦和孟加拉國的研究人員,檢查了70株大腸桿菌的基因組,這些菌株來自全球腸道多中心登記的感染兒童。研究(GEMS)。有些病例與死亡有關(guān),有些病例有癥狀但沒有死亡,有些則與癥狀無關(guān); 因此,科學(xué)家們可以獲得具有一系列結(jié)果的菌株。
他們分析了菌株之間的遺傳差異,并將其定位于疾病結(jié)果。然后,他們根據(jù)遺傳內(nèi)容和臨床結(jié)果將菌株分為幾類。拉斯科說,他們不確定遺傳變異如何與癥狀和結(jié)果相關(guān)聯(lián),但這種模式為進(jìn)一步研究提供了豐富的領(lǐng)域。他懷疑增加的大腸桿菌致死率是由一組基因相互作用而不是一個(gè)或兩個(gè)基因引起的。
“這項(xiàng)研究集中體現(xiàn)了IGS的全部意義,”IGS主任Claire M. Fraser博士說道。“我們希望采用基因組學(xué)方法,以新穎的方式使用它,這些方法可以為世界各地的臨床醫(yī)生提供實(shí)用的方法。”
在過去的幾年中,IGS在傳染病遺傳學(xué)研究中的作用越來越大。2014年,它獲得了國家過敏和傳染病研究所提供的5年1520萬美元的資助,用于開發(fā)基因組傳染病中心。
“Rasko博士及其同事的這項(xiàng)工作是科學(xué)家如何使用數(shù)據(jù)和基因組學(xué)來解決困難的公共衛(wèi)生問題的最前沿,”UM SOM Dean E. Albert Reece博士,醫(yī)學(xué)博士,MBA,同時(shí)也是馬里蘭大學(xué)醫(yī)學(xué)事務(wù)副主席,UM SOM的John Z.和Akiko Bowers杰出教授。“我相信他們將繼續(xù)在我們的斗爭中找出關(guān)鍵的線索,以改善世界各地患有疾病的人們的生活。”
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