該計(jì)算機(jī)程序使藥品專利密不透風(fēng)
制造拯救生命的藥物和其他藥物化合物的途徑是全球工業(yè)中受到最謹(jǐn)慎保護(hù)的商業(yè)秘密。波蘭和韓國的研究人員利用最近的工作編程計(jì)算機(jī)來識(shí)別導(dǎo)致藥學(xué)上復(fù)雜分子的合成途徑,并推出了計(jì)算機(jī)化方法,僅提出繞過基本藥物專利保護(hù)方面的合成策略。他們的工作出現(xiàn)在1月17日的Chem雜志上。
“當(dāng)我們開始這個(gè)項(xiàng)目時(shí),我有點(diǎn)懷疑機(jī)器會(huì)找到任何可行的合成替代品 - 畢竟,這些是價(jià)值數(shù)百萬美元的重磅炸彈藥物,我確信各自的公司已經(jīng)如此密集地覆蓋了專利領(lǐng)域沒有漏洞,“高級(jí)作者Bartosz Grzybowski說,他是蔚山國家科學(xué)技術(shù)研究所(韓國)和波蘭科學(xué)院的化學(xué)教授,也是有機(jī)合成軟件Chematica的首席開發(fā)人員。“事實(shí)證明,漏洞存在,我們可以找到新的逆轉(zhuǎn)合成途徑,完全繞過專利。”
這些藥品專利保護(hù)公司的知識(shí)產(chǎn)權(quán),同時(shí)也阻止競爭對(duì)手公司使用某些關(guān)鍵的合成解決方案 - 通過實(shí)驗(yàn)精心開發(fā),以最大限度地提高產(chǎn)量,提高純度和降低成本 - 在嘗試生產(chǎn)所需的化合物時(shí)。為了獲得可行的非專利選項(xiàng),研究人員“凍結(jié)”每個(gè)目標(biāo)分子的挑戰(zhàn)部分,迫使計(jì)算機(jī)在機(jī)械規(guī)則的基礎(chǔ)上替代非常規(guī)但化學(xué)上合理的方法。他們用三種具有不同化學(xué)障礙的著名商業(yè)藥物測(cè)試了他們的系統(tǒng):利奈唑胺,一種最后的抗生素; 西格列汀,一種抗糖尿病藥物; 和panobinostat,多發(fā)性骨髓瘤治療。
在每種情況下,當(dāng)允許在沒有約束的情況下運(yùn)行時(shí),程序推薦商業(yè)合成。但是,即使只有少數(shù)原子和債券被指定為不可接觸的,它通過應(yīng)用Chematica現(xiàn)有的功能來提出新的計(jì)劃,巧妙地避免那些已經(jīng)申請(qǐng)專利的計(jì)劃。“通過算法定位專利鉸鏈并將其傳播到Chematica的反合成樹下的關(guān)鍵債券,我們可以從替代但經(jīng)濟(jì)的起始材料中生成合成解決方案,實(shí)現(xiàn)真正的實(shí)際影響,”Grzybowski說。
Chematica的專利躲避能力也可能改變化學(xué)家對(duì)知識(shí)產(chǎn)權(quán)和專利法的處理方式。例如,機(jī)器輔助搜索可用于限制目標(biāo)分子的許多不同部分,將完全不同的合成集中到單個(gè)氣密專利中。然而,根據(jù)Grzybowski的說法,這樣的專利不一定會(huì)永遠(yuǎn)保持無孔,這要?dú)w功于未來可能通過實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)通過健康競爭推動(dòng)化學(xué)知識(shí)向前發(fā)展的新反應(yīng)。
總體而言,研究人員希望他們的軟件能夠幫助制藥公司更好地保護(hù)他們的知識(shí)產(chǎn)權(quán),同時(shí)通過提供與標(biāo)準(zhǔn)方法不同的合成路線,有助于加速有機(jī)化學(xué)的研究和開發(fā)。“這項(xiàng)工作說明了推動(dòng)化學(xué)家進(jìn)行算法思考,并要求計(jì)算機(jī)科學(xué)家掌握關(guān)鍵化學(xué)概念,提供超出學(xué)術(shù)界限的化學(xué)人工智能結(jié)果的好處,”共同作者Piotr Dittwald補(bǔ)充說,他是一名數(shù)學(xué)培訓(xùn)研究員和計(jì)算機(jī)科學(xué)。
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