誘導(dǎo)多功能干細胞揭示了人類和類人猿之間的差異
索爾克生物研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人員首次將黑猩猩和倭黑猩猩的皮膚細胞轉(zhuǎn)化為誘導(dǎo)多能干細胞(iPSCs),這是一種能夠在體內(nèi)形成任何其他細胞或組織的細胞。
2006年,日本京都大學(xué)的Kazutoshi Takahashi和Shinya Yamanaka發(fā)明了老鼠的iPSCs,人類的iPSCs也緊隨其后,并在去年獲得了諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎?,F(xiàn)在,科學(xué)家們經(jīng)常使用iPSCs來用細胞來模擬疾病,否則很難從活人或動物身上獲得這些細胞。通過添加四種關(guān)鍵因素的組合,皮膚細胞可以被制成iPSC,然后誘導(dǎo)iPSC在培養(yǎng)皿中形成肝、肺和腦細胞。
現(xiàn)在不僅可以用這些細胞來模擬疾病,還可以將人類的ipsc與我們的近親——類人猿——進行比較,從而了解是什么分子和細胞特征使我們成為人類。
將人類、黑猩猩和倭黑猩猩的細胞進行比較,可以為我們了解諸如感染、疾病、大腦進化、適應(yīng)或遺傳多樣性等生物過程提供線索。到目前為止,黑猩猩和倭黑猩猩細胞的來源僅限于死后組織或血液。例如,現(xiàn)在你可以從這三種不同的物種中產(chǎn)生神經(jīng)元,并將它們進行比較,以驗證假說。
在2013年10月23日發(fā)表在《自然》(Nature)雜志網(wǎng)絡(luò)版上的這項新研究中,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),人類和非人類靈長類動物細胞在跳躍基因或轉(zhuǎn)座(一種可以復(fù)制并粘貼到整個基因組的dna元素)的調(diào)控上存在差異??茖W(xué)家們說,跳躍基因提供了一種快速重組DNA的方法,可能正在塑造我們基因組的進化。
在索爾克的弗雷德·蓋奇(Fred Gage)、第六世和約翰·阿德勒(John Adler)的實驗室里,納韋扎、馬切托和同事們在人類、黑猩猩和倭黑猩猩的iPSCs中發(fā)現(xiàn)了差異表達的基因。
令該研究小組吃驚的是,其中兩個基因編碼的蛋白質(zhì)可以限制一種名為“長穿插元素1”(long interspersed element-1,簡稱L1)的跳躍基因。與非人類靈長類細胞相比,人類iPSCs表達了更高水平的這些限制性因子,即APOBEC3B和PIWIL2。“我們沒想到會這樣,”馬切托說。“這些基因吸引了我們的眼球,所以它們是我們首先關(guān)注的目標。”
L1和其他一些跳躍基因在我們的基因組中非常豐富。這些DNA片段的插入位置很難預(yù)測,它們會產(chǎn)生各種各樣的影響。例如,它們可能會完全擾亂基因,調(diào)節(jié)基因,或者導(dǎo)致基因被加工成全新的蛋白質(zhì)。
使用標記有熒光標記的L1,該小組觀察到非人類靈長類的熒光iPSCs數(shù)量高于人類。在單獨的實驗中,他們生產(chǎn)了帶有過多或過少的APOBEC3B和PIWIL2的iPSCs,如預(yù)期的那樣,他們發(fā)現(xiàn)這兩種蛋白質(zhì)的過量抑制了移動性并減少了新插入的DNA在非人類靈長類細胞中的出現(xiàn)。
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