NHGRI研究人員創(chuàng)建新的藥物代謝酶數(shù)據(jù)庫(kù)
在尋求新藥和更好藥物的過(guò)程中,研究人員必須權(quán)衡許多因素,包括每種化合物有效發(fā)揮作用并引起不良反應(yīng)的可能性。需要考慮的最重要的因素是化合物如何與肝酶家族相互作用,稱為細(xì)胞色素P450(CYP),它在藥物代謝中起著重要作用。
美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院化學(xué)基因組學(xué)中心(NCGC)和愛(ài)爾蘭都柏林三一學(xué)院的研究人員在一項(xiàng)有助于加速藥物發(fā)現(xiàn)的進(jìn)展中,迄今已對(duì)數(shù)千種藥物和可能藥物的CYP活性進(jìn)行了最全面的分析。候選人。他們的研究發(fā)表在2009年11月的Nature Biotechnology上。
CYP有57種,代謝了大約三分之二的藥物。然而,只有五個(gè)CYP處理這些藥物的80%。因此,研究人員著手分析這五種CYP與已知藥物庫(kù)之間的相互作用,以及一些稱為小分子的大型化學(xué)化合物庫(kù),篩選其作為可能藥物的潛力。
“該藥物代謝酶數(shù)據(jù)庫(kù)將改進(jìn)預(yù)測(cè)CYP-藥物反應(yīng)的當(dāng)前模型,并將成為未來(lái)藥物發(fā)現(xiàn)早期測(cè)試的資源,”該研究的資深作者Doug Auld博士表示。 NCGC基因組分析技術(shù)的領(lǐng)導(dǎo)者,由國(guó)家人類(lèi)基因組研究所(NHGRI)管理。
該研究的主要作者,NCGC研究助理,醫(yī)學(xué)博士Henrike Veith補(bǔ)充說(shuō):“這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)是同類(lèi)中最大的公共資源。”
為了進(jìn)行研究,研究人員使用了NCGC開(kāi)發(fā)的一種稱為定量高通量篩選(qHTS)的方法。該方法可快速分析各種濃度的化合物,可用于生成重要基因家族的大規(guī)模生物活性譜,并可用于鑒定用于生物醫(yī)學(xué)研究的化學(xué)探針。
研究人員使用qHTS來(lái)表征在藥物發(fā)現(xiàn)工作中篩選的數(shù)千種藥物和化合物中的CYP反應(yīng)。過(guò)去的研究只能解決幾百種化合物。相反,NCGC研究調(diào)查了超過(guò)17,000種化合物 - 每種化合物濃度為7種或更多 - 對(duì)抗5種關(guān)鍵代謝酶。
“這項(xiàng)研究突出了我們中心的獨(dú)特能力,”NCGC主任,該研究的共同作者,醫(yī)學(xué)博士Christopher P. Austin說(shuō)。“我們將創(chuàng)造性科學(xué)和最先進(jìn)技術(shù)結(jié)合在一起,使我們能夠在藥物發(fā)現(xiàn)的早期階段解決一個(gè)尚未解決的關(guān)鍵問(wèn)題。”
“只有通過(guò)這種類(lèi)型和規(guī)模的協(xié)同'大科學(xué)',我們才能真正地查詢那些與CYP代謝和早期藥物失效有關(guān)的分子因素。” 都柏林三一學(xué)院生物化學(xué)與免疫學(xué)院分子設(shè)計(jì)小組負(fù)責(zé)人David Lloyd博士補(bǔ)充說(shuō),他領(lǐng)導(dǎo)了愛(ài)爾蘭方面的合作。
有關(guān)CYP生物活性的新數(shù)據(jù)可通過(guò)免費(fèi)的PubChem數(shù)據(jù)庫(kù)(PubChem AID:1851)向全球研究界提供,該數(shù)據(jù)庫(kù)由國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館管理。
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