瘧原蟲寄生蟲的快速DNA分析
抗擊瘧疾的斗爭正在加劇?,F(xiàn)在,一項新技術(shù)使生物學(xué)家能夠比以前更快地操縱導(dǎo)致瘧疾的寄生蟲的基因40倍。結(jié)果報告在 Nature Methods中。
希望制造針對瘧疾的藥物和疫苗的生物學(xué)家研究模型生物體 伯氏瘧原蟲(Plasmodium berghei),它是人類瘧疾引起的寄生蟲的近親,它在蚊子和嚙齒動物之間傳播。 P. berghei有大約5,000個基因,定義每個基因的功能應(yīng)該有助于確定瘧疾寄生蟲的跟腱,英國劍橋Wellcome Trust Sanger研究所的生物學(xué)家Julian Rayner說。
然而,分析這些基因的標(biāo)準技術(shù)很慢。生物學(xué)家使用酶來復(fù)制寄生蟲基因的片段,然后對其進行變異以了解去除或破壞基因以確定基因功能的后果。將這些DNA片段儲存在 大腸桿菌中,直到它們準備好重新引入寄生蟲中。但是,它們結(jié)構(gòu)圓形,性質(zhì)脆弱。細菌拒絕任何破碎的DNA線圈。
該團隊包括來自沙特阿拉伯Thuwal的阿卜杜拉國王科技大學(xué)(KAUST)的生物學(xué)家Arnab Paint,通過設(shè)計大腸桿菌宿主可以耐受的非環(huán)狀DNA載體解決了這個問題 。
他們還使用了2011年初開發(fā)的一種技術(shù),該技術(shù)利用部分感染細菌的病毒來切割,修飾和重組DNA,同時將載體置于 大腸桿菌中。“而不是在實驗室的試管中做到這一點,經(jīng)常失敗并引入很多錯誤,我們操縱 大腸桿菌的機器為我們做的更準確,”團隊成員Oliver Billker,也是桑格研究所。
這些方法將允許團隊在8天內(nèi)制作96個載體 - 這是以前需要一年的壯舉。他們現(xiàn)在計劃建立一個覆蓋寄生蟲整個基因組的載體庫,供廣泛使用。
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