藍(lán)白斑篩選原理及問題總結(jié)
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[資源共享]藍(lán)白斑篩選原理及問題總結(jié)
1問題:做轉(zhuǎn)化時,用藍(lán)白斑篩選,以獲得陽性克隆。那它和直接利用AMP抗性,而不用藍(lán)白斑篩選,有什么區(qū)別嗎?藍(lán)白斑
篩選有什么作用嗎?
對于這一問題,我想,抗性篩選是防止雜菌生長。理論上說,當(dāng)培養(yǎng)基中含有抗生素時,只有攜帶相應(yīng)抗藥性基因載體的細(xì)胞
才能生存繁殖。藍(lán)白篩選是驗(yàn)證是否有插入片斷。兩者結(jié)合起來,更有利于篩選到我們的目的菌。
2問題:如果加了AMP、IPTG和X-Gal,長出來的白斑一定都是含有插入片段的嗎?有沒有可能是載體自連的?
答:可以說,世界上沒有絕對的事情,即使加了AMP、IPTG和X-Gal,長出來的白斑也不一定都是含有插入片段的陽性克隆,
具體原因可能有:
1)有可能是載體自連的假陽性;
2)作時AMP、IPTG和X-Gal其中一種或幾種沒涂均勻。
3)有時即使插入片段也會出現(xiàn)籃斑。只要編碼框沒被破壞。
3問題:如何篩選重組菌落?
答:可使用藍(lán)/白斑篩選法,在涂布有IPTG和X-Gal的篩選平板上,重組菌株為白,未轉(zhuǎn)入重組質(zhì)粒的菌株為藍(lán)。
4問題:藍(lán)白斑篩選如何篩選合適的宿主菌株?
答:如進(jìn)行藍(lán)/白斑篩選,宿主菌β-半糖苷酶的α-肽編碼區(qū)應(yīng)在染體或附加體上缺失掉(lacZΔΜ15)。TOP10和DH5α都
能用于藍(lán)/白斑篩選。
5問題:在藍(lán)白斑篩選的過程中沒有藍(lán)斑是什么原因?qū)е碌??因?yàn)橥ㄟ^PCR檢測插入片段的大小表明所挑的白斑克隆并沒有插
入片段。
答:原因很多,1)可能是你用的培養(yǎng)基含有糖或葡萄糖,因?yàn)榘胩歉拭笗纸馓?,?dǎo)致不能與X-Gal反應(yīng),葡萄糖不會
誘導(dǎo)融合基因的表達(dá)。2)作時AMP、IPTG和X-Gal其中一種或幾種沒涂均勻。3)很多因素會造成PCR失敗。
6問題:我最近轉(zhuǎn)化大腸桿菌時,通過藍(lán)白斑篩選,挑出白菌落做PCR,可是在電泳時發(fā)現(xiàn)在有目的帶的同時還有比目的帶
小的雜帶,不知為什么?我反復(fù)篩了幾次,都是這樣,可不可以搖菌提質(zhì)粒?我應(yīng)該下一步怎么做?
答:針對這樣的情況,我覺得,你首先做酶切鑒定,看看你的目的片段是否真正插入。其次,你應(yīng)該檢測PCR過程有沒有問題。
7問題:我用Amp-IPTG-X-galLB平板進(jìn)行藍(lán)白斑篩選重組子,為何篩出的全是白斑,沒一個藍(lán)斑,挑幾個白斑搖菌擴(kuò)增后PCR
檢測也全是陽性克隆,不會全都重組成功了吧?什么原因呢?
答:這樣的情況是完全有可能的,只要載體處理的好,應(yīng)該說是有這種可能。
藍(lán)白斑篩選原理:
藍(lán)白斑篩選是根據(jù)載體的遺傳特征篩選重組子,如α-互補(bǔ)、抗生素基因等?,F(xiàn)在使用的許多載體都帶有一個大腸桿菌的
DNA的短區(qū)段,其中有β-半糖苷酶基因(lacZ)的調(diào)控序列和前146個氨基酸的編碼信息。在這個編碼區(qū)中插入了一個多克
隆位點(diǎn)(MCS),它并不破壞讀框,但可使少數(shù)幾個氨基酸插入到β-半糖苷酶的氨基端而不影響功能,這種載體適用于可編
碼β-半糖苷酶C端部分序列的宿主細(xì)胞。因此,宿主和質(zhì)粒編碼的片段雖都沒有酶活性,但它們同時存在時,可形成具有酶
學(xué)活性的蛋白質(zhì)。這樣,lacZ基因在缺少近操縱基因區(qū)段的宿主細(xì)胞與帶有完整近操縱基因區(qū)段的質(zhì)粒之間實(shí)現(xiàn)了互補(bǔ),稱為α-
互補(bǔ)。由α-互補(bǔ)而產(chǎn)生的LacZ+細(xì)菌在誘導(dǎo)劑IPTG的作用下,在生底物X-Gal存在時產(chǎn)生藍(lán)菌落,因而易于識別。然而,
當(dāng)外源DNA插入到質(zhì)粒的多克隆位點(diǎn)后,幾乎不可避免地導(dǎo)致無α-互補(bǔ)能力的氨基端片段,使得帶有重組質(zhì)粒的細(xì)菌形成白
菌落。這種重組子的篩選,又稱為藍(lán)白斑篩選。如用藍(lán)白斑篩選則經(jīng)連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化的鈣化菌平板37℃溫箱倒置培養(yǎng)12-16hr后,
有重組質(zhì)粒的細(xì)菌形成白菌落。
IPTG與X-Gal介紹
IPTG即Isopropylβ-D-1-thiogalactopyranoside,也稱Isopropylβ-D-thiogalactoside,中文名為異丙基-β-D-硫代半糖苷。分子
式為C9H18O5S,分子量為238.30,CASNumber367-93-1,UltraPure,dioxanefree,常用于藍(lán)白斑篩選,如果在平板培養(yǎng)基
中加入X–Gal和IPTG,由于β–半糖苷酶的α–互補(bǔ)性,可以根據(jù)是否呈現(xiàn)白菌落(或噬菌斑)而方便地挑選出基因重組
體。此外,它還可以作為具有l(wèi)ac或tac等啟動子的表達(dá)載體的表達(dá)誘導(dǎo)物使用。
IPTG與X-Gal配置
X-Gal:中文名為5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半糖苷。X-Gal是β-半糖苷酶(β-galactosidase)的顯底物,在β-半糖苷酶的催化下
會產(chǎn)生藍(lán)產(chǎn)物。常用于β-半糖苷酶的原位染檢測以及藍(lán)白斑篩選。
IPTG配制成24mg/ml(100mM)的水溶液,并進(jìn)行過濾除菌后保存。
X-gal為5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D半糖苷。用二基甲酰胺DMF溶解X-gal配制成的20mg/ml的貯存液。保存于一玻璃管或聚丙
烯管中,裝有X-gal溶液的試管須用鋁箔封裹以防因受光照而被破壞,并應(yīng)貯存于-20℃。X-gal溶液無須過濾除菌。
使用方法:
在100ml的瓊脂培養(yǎng)基中,當(dāng)培養(yǎng)基溫度為55℃左右時,加入100μl的24mg/ml(100mM)IPTG、200μl的X-Gal(20mg/ml)
和100μl的Amp(100mg/ml),制作成IPTG、X-Gal、Amp平板培養(yǎng)基。
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