在波士頓細(xì)菌會議(BBM)是一年一度的會議，從波士頓地區(qū)和世界各地匯集細(xì)菌學(xué)專家。其第25次迭代于2019年6月6日至6月7日在波士頓哈佛大學(xué)科學(xué)中心舉行，來自100多個不同學(xué)術(shù)機構(gòu)和生物技術(shù)公司的約550名研究人員參加。會議旨在突出有關(guān)基礎(chǔ)和應(yīng)用細(xì)菌學(xué)的最新主題。

今年，主題演講者是丹尼斯蒙納克博士，斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)和免疫學(xué)教授，以及美國微生物學(xué)會的當(dāng)選研究員。

Monack介紹了她在細(xì)菌病原體弗朗西斯·圖拉菌(Francisellatularensis)和鼠傷寒沙門氏菌(SalmonellaTyphimurium)方面的工作，特別是與其同源真核傳感器以及細(xì)菌群落內(nèi)相互作用往往影響疾病過程的關(guān)系。她的小鼠模型也用于研究無癥狀和持續(xù)性沙門氏菌感染的確切機制。

除了主題演講之外，還討論了細(xì)菌調(diào)節(jié)和生理學(xué)，抗生素敏感性，新的抗菌工具，微生物方法的進(jìn)展，微生物群落，信號傳導(dǎo)和發(fā)病機制。

這是第一次引入短格式閃光講座，讓學(xué)員有機會在2019年波士頓細(xì)菌會議(BBM 2019)的全體觀眾面前展示他們的作品。還有一系列與小組成員的分組會議，處理不同的科學(xué)主題，多樣性，包括科學(xué)，職業(yè)道路，科學(xué)推廣，甚至細(xì)菌藝術(shù)。

抗菌素耐藥性 - 一個越來越相關(guān)的話題

在性傳播病原體淋病奈瑟菌中出現(xiàn)了對超廣譜頭孢菌素藥物(包括頭孢曲松)的易感性降低。由于沒有明確的下一代藥劑，淋病的有效治療的未來是危險的。

在BBM 2019期間，Samantha Palace等人。首次報道了臨床淋球菌分離株對超廣譜頭孢菌素藥物敏感性降低的機制，該機制與目標(biāo)青霉素結(jié)合蛋白的遺傳變異無關(guān)。

鑒定這種類型的抗性機制對于分子診斷測試的發(fā)展具有顯著意義，但也對淋病的抗微生物抗性的監(jiān)測具有顯著意義。

Jenna I. Wurster等。假設(shè)宿主的代謝狀態(tài)可以通過激活與微生物代謝相關(guān)(或受其調(diào)節(jié))的耐受性和抗性途徑，顯著影響微生物組中的抗生素敏感性。

通過利用鏈脲佐菌素誘導(dǎo)的急性高血糖模型，來自布朗大學(xué)和華盛頓大學(xué)的這些研究人員結(jié)合了兩種方法來研究抗生素治療對小鼠微生物組的影響：宏基因組分類學(xué)分析以及整個社區(qū)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)/代謝組學(xué)。

他們的研究結(jié)果表明，高血糖群落中存活的分類群顯示出一定程度的抗生素耐受性/脫敏作用，這是由宿主衍生因子的差異驅(qū)動的，最終強調(diào)了微生物組對宿主代謝的反應(yīng)。

新的抗生素即將來臨......

Photorhabdus spp。與昆蟲線蟲共生并產(chǎn)生抗生素以保護(hù)食物來源免受其他微生物的侵害。研究人員證明了一種新型抗生素對革蘭氏陰性病原體(甚至對抗粘菌素耐藥的大腸桿菌和銅綠假單胞菌)的功效。BBM的一個大型國際研究小組展示了細(xì)菌屬Photorhabdus的代表如何在其基因組中含有無數(shù)未開發(fā)的生物合成次級代謝物基因簇。

結(jié)核病是一種高度傳染性疾病，每年導(dǎo)致150萬人死亡。來自麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)，威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院，哈佛大學(xué)陳公共衛(wèi)生學(xué)院和馬薩諸塞大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Eachan O. Johnson及其同事證明了大規(guī)模化學(xué) - 遺傳相互作用分析如何產(chǎn)生新型抑制劑特別針對結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)，這是該病的致病因子。

通過鑒定特定的化學(xué) - 遺傳相互作用，他們已經(jīng)鑒定了RNA聚合酶的新抑制劑和迄今未描述的靶標(biāo)，即外排蛋白EfpA。

推進(jìn)微生物方法和篩選微生物群落

近年來，下一代DNA測序揭示了患者樣本和環(huán)境中巨大的細(xì)菌遺傳變異。Max G. Schubert等人的工作。已經(jīng)證明了體內(nèi)單鏈DNA的產(chǎn)生如何成為生成大腸桿菌條形碼突變體庫的通用方法的傾向。

此外，由Stacie Clark等人建立的新型體外系統(tǒng)。來自波士頓的分析可以分析組織中的細(xì)菌生長動態(tài)，并能夠識別對常駐免疫細(xì)胞有反應(yīng)的細(xì)菌亞群，這在以前很難被發(fā)現(xiàn)。

盡管微生物群落在醫(yī)學(xué)，生物技術(shù)，農(nóng)業(yè)和環(huán)境科學(xué)中具有過多的潛在應(yīng)用，但研究種間相互作用和依賴性的準(zhǔn)確性受到限制。

在BBM 2019年期間，Anthony Artiz等人。揭示了kChip - 一個基于液滴的平臺，用于快速，自下而上，平行構(gòu)建和篩選合成微生物群落。這種類型的篩選方法可以用于基本和應(yīng)用的微生物生態(tài)學(xué)，并且可以確定具有任何光學(xué)可測定功能的多物種聚生體(例如病原體抑制，生物控制劑的促進(jìn)以及頑固底物的降解)。

不同的研究暗示了工業(yè)化人類如何喪失某些腸道微生物，并且這種微生物多樣性的喪失可能與各種慢性疾病有關(guān)。為了發(fā)現(xiàn)已滅絕的細(xì)菌物種，Marsha C. Wibowo及其同事進(jìn)行了獵槍宏基因組測序，以創(chuàng)建迄今為止最大的古生物(兩千年)微生物基因組重建。

Wibowo描述了腸道共生體在基因，基因組和通路水平上的進(jìn)化歷史，這可能導(dǎo)致發(fā)現(xiàn)具有恢復(fù)人類健康潛力的滅絕細(xì)菌。換句話說，有可能“復(fù)活”再次對我們有益的老朋友。