抗生素如何導(dǎo)致腸道細(xì)菌選擇
在本周發(fā)表在Nature Communications上的一項(xiàng)研究中,研究人員對(duì)個(gè)體患者幽門螺桿菌的種群結(jié)構(gòu)進(jìn)行了表征,證明了抗生素在其患者內(nèi)部進(jìn)化中的重要作用。
幽門螺桿菌是一種全球性胃細(xì)菌,是人類中最常見(jiàn)的慢性感染之一。這種感染不會(huì)引起可定義的癥狀,但可導(dǎo)致一系列胃腸道病變,包括胃內(nèi)膜炎癥和胃和十二指腸腫瘤。
胃通常分為三個(gè)主要解剖區(qū)域,這些區(qū)域通過(guò)其生理和功能來(lái)區(qū)分,為不同的幽門螺桿菌亞群提供生態(tài)位。“使用從胃的不同區(qū)域獲得的樣本,我們?cè)儐?wèn)幽門螺桿菌菌株在每個(gè)患者中的差異程度,”慕尼黑LMU的資深作者Sebastian Suerbaum說(shuō)。“為此,我們從每位患者中分離出至少20株細(xì)菌,并通過(guò)各種測(cè)序方法分析其基因組。”
另外,抗生素的使用對(duì)幽門螺桿菌的遺傳多樣性具有顯著影響。在一個(gè)特定患者中,初始樣品中的幽門螺桿菌群體是高度多樣化的并且沒(méi)有顯示出抗生素抗性的跡象。然而,在2年后收集的樣本中,群體內(nèi)的多樣性水平極低,并且細(xì)菌對(duì)前線抗生素完全抗性。結(jié)果顯示幽門螺旋桿菌確實(shí)能夠適應(yīng)胃的每個(gè)解剖學(xué)上限定的區(qū)域中普遍存在的特定條件。這種適應(yīng)性可以在例如編碼生物體外膜蛋白的基因家族中找到,所述基因家族用于將其附著于其人宿主中的胃上皮細(xì)胞。
研究人員發(fā)現(xiàn)接觸抗生素對(duì)他們研究的所有幽門螺旋桿菌種群產(chǎn)生了深遠(yuǎn)的影響。“通常情況下,應(yīng)用最合適的抗生素組合對(duì)于從胃中徹底根除幽門螺桿菌并防止出現(xiàn)抵抗力至關(guān)重要,”Suerbaum總結(jié)道。“然而,現(xiàn)在越來(lái)越明顯的是,近幾十年來(lái)抗生素對(duì)整個(gè)物種的進(jìn)化動(dòng)態(tài)產(chǎn)生了巨大的影響,因?yàn)榭股匾呀?jīng)變得容易獲得,并且越來(lái)越多地被用于全世界。”
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