Discovery允許科學(xué)家同時(shí)對(duì)數(shù)千個(gè)細(xì)胞進(jìn)行索引比現(xiàn)有方法提高了40倍
在典型人體中的37萬(wàn)億個(gè)細(xì)胞中,區(qū)分一種細(xì)胞與另一種細(xì)胞的能力并不像你想象的那么簡(jiǎn)單。OHSU科學(xué)家首次開(kāi)發(fā)出一種快速有效識(shí)別體內(nèi)細(xì)胞亞型的方法。由Andrew Adey博士實(shí)驗(yàn)室的研究人員帶領(lǐng),這一發(fā)現(xiàn)將在分子水平上提高對(duì)疾病的認(rèn)識(shí)。這項(xiàng)新技術(shù)最終可以開(kāi)發(fā)精確的治療方法,如癌癥,破壞大腦神經(jīng)元的疾病,以及影響心臟和血管的疾病。
研究結(jié)果將于4月9日發(fā)表在Nature Biotechnology雜志上。該新技術(shù)提供了一種擴(kuò)大先前已知的用于分析細(xì)胞類型的方法的方法,所述細(xì)胞類型通過(guò)研究其DNA的化學(xué)標(biāo)記的模式來(lái)區(qū)分。
“在任何存在細(xì)胞類型異質(zhì)性[多樣性]的環(huán)境中,這將是非常有價(jià)值的,”Adey說(shuō),他是OHSU醫(yī)學(xué)院分子和醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)助理教授,也是奈特心血管研究所的成員。“感興趣的主要領(lǐng)域是癌癥和神經(jīng)科學(xué),但我們也將其應(yīng)用于心血管疾病。”
所有細(xì)胞都攜帶相同的基因組,即細(xì)胞內(nèi)編碼的完整基因組。基因在給定細(xì)胞中表達(dá)的模式是區(qū)分神經(jīng)元與肝細(xì)胞的區(qū)別。即便如此,事實(shí)證明類似細(xì)胞之間存在差異。2017年,科學(xué)家通過(guò)測(cè)量它們之間的化學(xué)標(biāo)記 - 與其DNA連接的甲基模式(稱為甲基化組),展示了一種辨別神經(jīng)元亞型的方法。
Adey和共同作者的新研究開(kāi)發(fā)了一種方法,通過(guò)向測(cè)序儀器讀出的每個(gè)細(xì)胞添加獨(dú)特的DNA序列組合或指數(shù),一次分析大量單個(gè)細(xì)胞的甲基化組??茖W(xué)家們?cè)趲追N人類細(xì)胞系和小鼠大腦中使用了新的索引方法來(lái)揭示3,282個(gè)單細(xì)胞的甲基化組。這與現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序方法相比,吞吐量大約增加了40倍。
“我們可以同時(shí)分析數(shù)千個(gè)細(xì)胞,”Adey說(shuō)。“這項(xiàng)技術(shù)將單細(xì)胞DNA甲基化文庫(kù)的制備成本降低到每個(gè)細(xì)胞50美分,每個(gè)細(xì)胞從20美元到50美元不等。”
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