來自全球人類腸道微生物組的未培養(yǎng)基因組的新見解
主要是由于在實(shí)驗(yàn)室條件下培養(yǎng)微生物的挑戰(zhàn),人類腸道微生物組中許多物種的基因組序列仍然未知。為了解決這個(gè)問題,我們從來自地理和表型多樣化的人類受試者的3,810個(gè)糞便宏基因組中重建了60,664個(gè)原核生物基因組。
這些基因組為2,058個(gè)以前未知的物種級操作分類單位(OTU)提供參考點(diǎn),表示測序腸道細(xì)菌的系統(tǒng)發(fā)育多樣性增加50%。平均而言,新的OTU占每個(gè)人豐富度的33%和物種豐度的28%,并且富含來自農(nóng)村人口的人類。臨床腸道微生物組研究的薈萃分析確定了新OTU的多種疾病關(guān)聯(lián),這些聯(lián)系有可能改善預(yù)測模型。最后,
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