大數(shù)據(jù)有助于發(fā)現(xiàn)推動血細(xì)胞規(guī)格的關(guān)鍵因素
由伯明翰大學(xué)的研究人員以及劍橋大學(xué),利茲大學(xué)和曼徹斯特大學(xué)的研究小組領(lǐng)導(dǎo)的新研究已經(jīng)確定了通過在培養(yǎng)皿中重現(xiàn)這一過程來推動血細(xì)胞發(fā)育的關(guān)鍵因素。具有產(chǎn)生血液能力的細(xì)胞通常在早期胚胎中在許多發(fā)育階段中被指定,并最終形成血液干細(xì)胞,其終生維持并且每天產(chǎn)生數(shù)萬億個(gè)血細(xì)胞。
通過研究六個(gè)連續(xù)發(fā)展階段并采用計(jì)算分析采用“大數(shù)據(jù)”方法,由生物技術(shù)和生物科學(xué)研究委員會資助的該聯(lián)盟研究了數(shù)千種基因的行為及其調(diào)控因素。
他們的發(fā)現(xiàn)發(fā)表于發(fā)育細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)了之前未知的血細(xì)胞發(fā)育調(diào)節(jié)因子,顯著進(jìn)一步提升了我們對這一過程的認(rèn)識。他們還解釋了DNA中的調(diào)控元素如何協(xié)同工作,推動基因表達(dá)以及將一個(gè)發(fā)育階段轉(zhuǎn)換為另一個(gè)發(fā)展階段。
這些數(shù)據(jù)還揭示了從不相關(guān)的培養(yǎng)細(xì)胞類型產(chǎn)生血細(xì)胞的最低要求,這種方法對于再生醫(yī)學(xué)產(chǎn)生患者特異性血細(xì)胞至關(guān)重要。為了接觸科學(xué)界和感興趣的公眾,小組創(chuàng)建了一個(gè)允許無限制數(shù)據(jù)訪問的網(wǎng)站。
該團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,提高對驅(qū)動血細(xì)胞規(guī)格的關(guān)鍵基因的了解以及它們?nèi)绾蜗嗷プ饔脤⒂兄诋a(chǎn)生干細(xì)胞,可用于幫助患有血液疾病的患者,如骨髓性白血病。
來自伯明翰大學(xué)的Constanze Bonifer教授解釋說:“我們通過收集測量基因活性,染色體結(jié)構(gòu)變化以及調(diào)控因子與基因本身相互作用的”多組學(xué)“數(shù)據(jù),研究了胚胎細(xì)胞如何向血細(xì)胞發(fā)展。以前所未有的細(xì)節(jié)展示了巨大的相互作用基因網(wǎng)絡(luò)如何控制血細(xì)胞的發(fā)育。它還展示了我們?nèi)绾问褂眠@些數(shù)據(jù)來增強(qiáng)我們對這一過程的認(rèn)識“
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