中文字幕在线天|亚洲一区二区三区手机版|少妇中文字幕乱码亚洲影视|最好看的久久综合伊人



      

      
  

      

      
	
	

      

      



      

	
      

      
	
      
  	       
      
       中國(guó)基因網(wǎng)您的位置：首頁(yè) >國(guó)內(nèi)研究 >        
      
  
      
		
      
			
      算法提供了對(duì)細(xì)胞發(fā)育的深入了解
      
			
      
				2019-01-16 10:27:19
				?
			  來(lái)源：
			
      
		
      
				
		
      
			
      通過(guò)RNA測(cè)序，研究人員可以測(cè)量哪些基因在樣品的每個(gè)單個(gè)細(xì)胞中表達(dá)。一種新的統(tǒng)計(jì)方法允許研究人員從由異步階段組成的細(xì)胞混合物中推斷出不同的發(fā)育過(guò)程。HelmholtzZentrumMünchen的研究人員與慕尼黑技術(shù)大學(xué)的同事們?cè)贜ature Methods雜志上發(fā)表了這一發(fā)現(xiàn)。
      

      算法提供了對(duì)細(xì)胞發(fā)育的深入了解
      

      今天，細(xì)胞生物學(xué)不再只關(guān)注靜態(tài)，而是試圖了解細(xì)胞的動(dòng)態(tài)發(fā)展。對(duì)此的一個(gè)實(shí)例是形成各種類(lèi)型的血細(xì)胞，例如來(lái)自其前體的血紅細(xì)胞或內(nèi)皮細(xì)胞，血液干細(xì)胞。為了理解這個(gè)過(guò)程是如何進(jìn)行遺傳控制的，科學(xué)家們通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析來(lái)分析哪些基因是表達(dá)的。
      

      “對(duì)我而言，我們現(xiàn)在甚至能夠確定單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組仍然令人驚訝“主要作者Laleh Haghverdi說(shuō)，”尤其是當(dāng)人們意識(shí)到典型的細(xì)胞只含有幾皮克的RNA時(shí)。這些數(shù)據(jù)的可用性現(xiàn)在開(kāi)始徹底改變?cè)S多研究領(lǐng)域，但需要新的統(tǒng)計(jì)方法來(lái)解釋這些“例如，樣本的所有單元格都不會(huì)同步開(kāi)始它們的開(kāi)發(fā)，它們的開(kāi)發(fā)需要不同的時(shí)間長(zhǎng)度。因此，我們總是在處理動(dòng)態(tài)混合物，“HelmholtzZentrumMünchen計(jì)算生物學(xué)研究所(ICB)的博士生Haghverdi補(bǔ)充道。”從這個(gè)過(guò)程構(gòu)建多個(gè)步驟是非常困難的，特別是因?yàn)榧?xì)胞僅適用于一次測(cè)量。“
      

      歡迎來(lái)到偽時(shí)代
      

      為了從單個(gè)時(shí)間點(diǎn)的測(cè)量來(lái)解密發(fā)展過(guò)程，準(zhǔn)快照測(cè)量，由ICB主任Fabian Theis博士教授領(lǐng)導(dǎo)的研究人員開(kāi)發(fā)了一種稱(chēng)為擴(kuò)散偽定法的算法來(lái)解釋單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)。該算法在虛擬時(shí)間線(xiàn)上對(duì)細(xì)胞進(jìn)行排序 - 偽時(shí)間 - 沿著它們顯示轉(zhuǎn)錄組中的連續(xù)變化。因此，可以重建哪些基因順序表達(dá)。通過(guò)這種方法，研究人員可以圖形顯示不同細(xì)胞類(lèi)型的發(fā)育路徑的分支譜系。
      

      “例如，我們可以展示一個(gè)相對(duì)均勻的血液干細(xì)胞群如何發(fā)展成不同的細(xì)胞類(lèi)型，”研究負(fù)責(zé)人Theis說(shuō)。“有些人變成了紅細(xì)胞，有些則分化成內(nèi)皮細(xì)胞。我們可以根據(jù)單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)追蹤這些命運(yùn)。” 此外，科學(xué)家還獲得了關(guān)于哪些基因開(kāi)關(guān)的信息。發(fā)現(xiàn)處于不同發(fā)育階段的相對(duì)分散的細(xì)胞混合物可以在計(jì)算機(jī)上解開(kāi)，并且在分析之后，提供正在進(jìn)行的各個(gè)步驟的清晰圖像。
      

      然而，這只是研究人員的開(kāi)始，因?yàn)檠盒纬傻倪^(guò)程相對(duì)容易理解。它們僅作為測(cè)試對(duì)象來(lái)確定方法的工作情況。“在未來(lái)，我們希望將重點(diǎn)放在迄今為止仍然難以捉摸的過(guò)程中，或者根本不會(huì)被發(fā)現(xiàn)的過(guò)程，”Theis說(shuō)。
      
			

			
        
      
			
      
            鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請(qǐng)第一時(shí)間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。
			
      
			
			
      
        
      推薦內(nèi)容