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      基于NGS的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性測定方法的開發(fā)與評估
      
			
      
				2019-10-20 14:37:08
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      該測定法具有臨床相關(guān)的五天周轉(zhuǎn)時間，一次可處理多達20 ng的基因組DNA，批次大小可多達40個樣品。針對多種組織學(xué)的FFPE樣品，評估了準(zhǔn)確性，可重復(fù)性，精密度以及對照樣品性能的分析性能，以解決分析前的變異性和分析變異性。
      

      基于NGS的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性測定方法的開發(fā)與評估
      

      美國紐約州布法羅市OmniSeq Inc.的Sean T. Glenn博士，美國紐約州布法羅市羅斯韋爾公園綜合癌癥中心個性化醫(yī)學(xué)中心，美國紐約州14263，羅斯韋爾公園綜合癌癥中心分子與細胞生物學(xué)系美國紐約州布法羅市(Buffalo)14263說，“微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)是一種被充分描述的現(xiàn)象，其特征是被稱為微衛(wèi)星的DNA短重復(fù)區(qū)域的長度發(fā)生了變化。”
      

      擴增后，手動檢查每個微衛(wèi)星的片段分析色譜圖，以評估來自同一患者的腫瘤樣品與正常樣品之間的差異，以便確定每個微衛(wèi)星的長度差異或所謂的不穩(wěn)定性。
      

      盡管CRA和EEM占了微衛(wèi)星不穩(wěn)定腫瘤的大多數(shù)，但微衛(wèi)星不穩(wěn)定性在其他各種腫瘤中的發(fā)生率較低，但發(fā)生率很高。
      

      因此，由于難以獲得正常組織導(dǎo)致周轉(zhuǎn)時間不足或無法完成微衛(wèi)星測試，正常DNA的需求會限制能夠進行測試的患者數(shù)量。
      

      盡管還有其他發(fā)表的研究使用NGS測試來評估MSI狀態(tài)，以及使用常規(guī)片段分析而沒有匹配正常值的研究，但作者開發(fā)了第一個敏捷NGS平臺，該平臺已獲得臨床實驗室改進修正案的認證，并獲得了紐約州臨床實驗室評估計劃的批準(zhǔn)使用新一代測序技術(shù)可用于患者的臨床MSI測試，可在所有實體瘤中使用，而無需匹配的正常組織。
      

      格倫研究小組得出結(jié)論：
      

      總體而言，我們已經(jīng)開發(fā)出了首個獲得NYS-CLEP批準(zhǔn)，經(jīng)過分析驗證的MSI分析，該分析需要最少的腫瘤DNA輸入，而無需匹配的正常人，并且與組織學(xué)無關(guān)。
      
			

			
        
      
			
      
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