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      分析古代基因組以了解瘟疫

      Justinianic瘟疫始于541年的東羅馬帝國。經(jīng)常爆發(fā)的肆虐歐洲和地中海盆地大約200年,摧毀了羅馬世界25%的人口。最近的遺傳研究表明,鼠疫耶爾森氏菌是該病的病因,但它如何傳播以及菌株之間的關系尚不清楚。

      分析古代基因組以了解瘟疫

      在昨天在PNAS上發(fā)表的這項研究中,研究人員分析了奧地利,英國,德國,法國和西班牙的21個遺址中的人類遺骸。他們重建了8個鼠疫桿菌基因組,使他們能夠?qū)⑦@些菌株與之前發(fā)表的古代和現(xiàn)代基因組進行比較。

      “這項研究通過比較幾千年來的基因組來展示古生物學研究對于理解歷史和現(xiàn)代大流行的潛力,”馬克斯普朗克人類歷史科學研究所的資深作者約翰內(nèi)斯克勞斯解釋說。

      該團隊還從英格蘭撒克遜地區(qū)的Edix Hill發(fā)現(xiàn)了英國最早的瘟疫遺傳證據(jù)。他們使用考古測年和這種菌株在進化樹中的位置相結(jié)合,得出結(jié)論,基因組很可能與公元544年不列顛群島中模糊描述的瘟疫有關。

      “檢索跨越廣泛地理和時間范圍的基因組使我們有機會評估在第一次大流行期間在歐洲出現(xiàn)的鼠疫菌的微觀多樣性,”共同第一作者馬塞爾凱勒說。

      新發(fā)現(xiàn)的基因組顯示,在第一次大流行的200年間,有多種密切相關的鼠疫菌流行,有些可能在同一時間和同一地區(qū)。“所有基因組屬于同一血統(tǒng)的事實表明在這段時間內(nèi)歐洲或地中海盆地的瘟疫持續(xù)存在,而不是多次重新引入,”凱勒補充說。

      此外,在第一次大流行結(jié)束時出現(xiàn)的鼠疫基因組顯示其遺傳密碼中存在大量缺失,其中包括兩種毒力因子。大約800 - 1000年后第二次大流行晚期的鼠疫基因組顯示出覆蓋基因組相同區(qū)域的類似缺失。

      “這是趨同進化的一個可能的例子,這意味著這些鼠疫菌株獨立地進化出相似的特征,”共同第一作者Maria Spyrou說。“這些變化可能反映了對歐亞大陸西部一個獨特的生態(tài)位的適應性,在這兩個流行病中,瘟疫正在流行。”

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