RNA發(fā)現(xiàn)可以改善干細胞研究
發(fā)現(xiàn)最近描述的與基因表達密切相關的各種RNA主要是細胞類型特異性的,這提高了這種RNA序列可能能夠用作干細胞研究中的標記的可能性。該研究發(fā)表在Nature Structural and Molecular Biology上,由Vasil Galat博士,病理學研究助理教授共同撰寫。
只有大約20%的RNA編碼蛋白質,其余80%稱為非編碼RNA,被認為參與了多種細胞過程,包括RNA翻譯,剪接和DNA復制。
非編碼RNA可以進一步分為微RNA和長非編碼RNA,超長一半的非編碼RNA是富含染色質的(cheRNA),其中染色質環(huán)繞RNA鏈,然后被RNA聚合酶結合根據(jù)先前的研究,II位于基因啟動子附近。據(jù)加拉特稱,這種物理接近轉化為功能連接。
在目前的研究中,Galat和該研究的其他共同作者發(fā)現(xiàn),cheRNA序列也與不同類型的細胞最終的遺傳表達特異性相關。
“因為它們與啟動子區(qū)域有很好的聯(lián)系,它們可以用作啟動子區(qū)域特定基因的預測因子,”Galat說。“一旦你看到表達的cheRNA,就可以判斷出基因的位置。”
根據(jù)加拉特的說法,生物學家目前使用幾種方法來定位基因啟動子區(qū)域,但這種方法可能更加可靠和精確?,F(xiàn)在,cheRNA是細胞類型特異性的發(fā)現(xiàn)在他的主要研究領域中具有特別誘人的應用:多能干細胞。
多能干細胞是未分化的,這意味著它們可以發(fā)育成人體中幾乎任何類型的細胞。將它們保持在多能階段可能會很棘手,這就是為什么加拉特實驗室被邀請與芝加哥大學領導的項目合作。
“我們的實驗室在處理多能細胞方面擁有豐富的經(jīng)驗,”Galat說。“這些細胞需要經(jīng)驗來維持。它們在培養(yǎng)中一直在自發(fā)地區(qū)分。”
從理論上講,通過建立細胞類型和相關cheRNA的數(shù)據(jù)庫,cheRNA可以用作標記,以縮小多能干細胞轉化為細胞類型- 使用現(xiàn)有設備的艱巨任務。
“許多類型的細胞在文化上看起來都非常相似,”加拉特說。“你可以檢查標記,但許多標記重疊 - 所以區(qū)分細胞類型你必須使用許多標記。相反,如果你可以分離cheRNA,它可以定義你正在處理的細胞類型和功能成熟它們是如何“。
他甚至希望科學家能夠在未來的某個時刻使用cheRNA來積極指導分化。
更精確地操縱多能細胞可以加速具有特定功能的基因工程細胞的過程 - 例如,產(chǎn)生免疫系統(tǒng)的高功能細胞,其幾乎涉及健康的每個方面。
“這是cheRNA最有趣的特征,”Galat說。“它可以作為表征細胞類型的一種方式,也可以作為指導多能細胞發(fā)育成特定細胞類型的方法。”
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