研究為IBD微生物組概況提供了最全面的觀察
炎癥性腸病(IBD),包括克羅恩病和潰瘍性結(jié)腸炎,影響全世界數(shù)百萬人。IBD概況可以變化很大,使其成為難以有效治療的疾病。
在一項(xiàng)新研究中,來自哈佛大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院和麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)廣泛研究所的研究人員編制了一系列復(fù)雜的化學(xué)和分子事件,這些事件在IBD爆發(fā)期間破壞微生物組并引發(fā)免疫反應(yīng)。這種多組學(xué)方法可以更深入地了解疾病中涉及的微生物變化和遺傳變化,并可以為未來治療的發(fā)展提供信息。他們的研究結(jié)果發(fā)表在Nature上。
該研究是2007年啟動(dòng)的人類微生物組計(jì)劃的一部分。
該研究對132名參與者進(jìn)行了為期一年的研究,其中一些參與IBD和其他非IBD對照。在一年中定期取樣,在診所收集總共651個(gè)活組織檢查樣本和529個(gè)血液樣本,并且使用本地出貨協(xié)議每兩周收集另外1,785個(gè)糞便樣本。在糞便樣品的幾個(gè)全球時(shí)間點(diǎn)產(chǎn)生每個(gè)參與者的宏基因組,元轉(zhuǎn)錄組,蛋白質(zhì)組,代謝組和病毒體。活組織檢查產(chǎn)生了額外的基因組測序數(shù)據(jù),其與血液測序譜相匹配。所有數(shù)據(jù)均可在https://ibdmdb.org/上獲得。
這些發(fā)現(xiàn)提供了IBD患者中微生物組迄今最詳細(xì)的觀察。他們發(fā)現(xiàn)不同形式的IBD對微生物組的活性和組成有不同的影響。這些可以導(dǎo)致更好的早期檢測IBD癥狀的能力以及疾病治療的開發(fā)和部署。這些豐富的信息使研究人員能夠證實(shí)以往研究的結(jié)果,例如整體腸道生態(tài)多樣性的減少和疾病期間某些微生物的增加。最重要的是,他們能夠確定變化的原因。在疾病活動(dòng)期間,觀察到患有IBD的人具有較少的微生物衍生化學(xué)品,可能是由于微生物代謝較少,營養(yǎng)吸收較差或其他因素。這些因素可降低腸道微生物生態(tài)系統(tǒng)的整體穩(wěn)定性,并導(dǎo)致更多不適當(dāng)?shù)拿庖叻磻?yīng)。
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