用計(jì)算質(zhì)譜鑒定新化合物
研究人員開發(fā)了一種新的計(jì)算質(zhì)譜系統(tǒng),可以識別不同生物體的整套代謝物,從而快速識別潛在的治療化合物。根據(jù)自然方法論文,該方法在來自12種植物物種的選擇組織上進(jìn)行了測試,并且能夠記錄超過一千種代謝物。該研究由RIKEN可持續(xù)資源科學(xué)中心(CSRS)的科學(xué)家完成。
自從現(xiàn)代醫(yī)學(xué)出現(xiàn)以來,已知植物是治療化合物的來源,并且今天仍然如此。然而,對數(shù)百萬種植物進(jìn)行分類可能需要很長時(shí)間,每種植物都含有各自不同的代謝組以確定新的目標(biāo)化合物。
質(zhì)譜法是鑒定樣品是否含有給定化合物的有效工具,但發(fā)現(xiàn)新化合物要困難得多。
因此,CSRS研究人員試圖創(chuàng)建一種計(jì)算質(zhì)譜技術(shù),以使其更容易。計(jì)算質(zhì)譜是一個(gè)不斷發(fā)展的研究領(lǐng)域,專注于尋找以前未知的代謝物并預(yù)測它們的功能。
該系統(tǒng)的特征在于水稻和玉米中的一類抗生素以及在洋蔥,西紅柿和馬鈴薯中發(fā)現(xiàn)的一類抗炎和抗菌化合物。為了開發(fā)這項(xiàng)技術(shù),研究人員創(chuàng)造了幾種新算法,用于比較用碳-13標(biāo)記的植物和不用碳-13標(biāo)記的植物的質(zhì)譜輸出。這些算法預(yù)測了植物代謝物的分子式,并通過它們對它們進(jìn)行分類。算法繼續(xù)預(yù)測代謝物的結(jié)構(gòu),并將這些結(jié)構(gòu)與其他已知代謝物進(jìn)行比較,以預(yù)測功能。
研究人員相信這種技術(shù)可以幫助其他研究領(lǐng)域。在他們的下一個(gè)項(xiàng)目中,他們計(jì)劃使用該方法來分析人類和微生物群的代謝組。
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